88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0373 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  73.3 
 
 
457 aa  714    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  100 
 
 
457 aa  946    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  65.43 
 
 
457 aa  638    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  73.09 
 
 
457 aa  700    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  70.68 
 
 
457 aa  694    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  72.43 
 
 
457 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  71.55 
 
 
457 aa  666    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  73.09 
 
 
457 aa  701    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  64.77 
 
 
457 aa  613  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  61.05 
 
 
456 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  59.08 
 
 
456 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  59.83 
 
 
456 aa  557  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  59.3 
 
 
456 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  58.08 
 
 
456 aa  547  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  58.64 
 
 
456 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  59.08 
 
 
456 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  57.42 
 
 
456 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  57.91 
 
 
456 aa  531  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  55.01 
 
 
457 aa  502  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  56.19 
 
 
460 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  56.18 
 
 
456 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  54.67 
 
 
454 aa  501  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  53.11 
 
 
456 aa  501  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  57.08 
 
 
456 aa  498  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  57.08 
 
 
456 aa  499  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  56.64 
 
 
456 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  53.9 
 
 
460 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  53.33 
 
 
456 aa  485  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  55.13 
 
 
455 aa  485  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  52.32 
 
 
459 aa  482  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  56.24 
 
 
455 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  51.22 
 
 
454 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  52.68 
 
 
454 aa  477  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  51.33 
 
 
456 aa  477  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  53.35 
 
 
454 aa  473  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  53.35 
 
 
454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  55.13 
 
 
455 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  56.46 
 
 
455 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  53.39 
 
 
452 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  55.53 
 
 
456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  50.33 
 
 
454 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  54.02 
 
 
457 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  56.64 
 
 
455 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  52.68 
 
 
460 aa  442  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  49.44 
 
 
454 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  49.22 
 
 
465 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  47.95 
 
 
484 aa  404  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  50.34 
 
 
458 aa  385  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  48.38 
 
 
470 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  42.7 
 
 
393 aa  350  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  39.82 
 
 
453 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  39.14 
 
 
453 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  38.91 
 
 
453 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  38.01 
 
 
453 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  42.03 
 
 
451 aa  285  9e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  37.67 
 
 
462 aa  262  8e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  28.57 
 
 
443 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  28.61 
 
 
432 aa  178  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  28.84 
 
 
427 aa  163  7e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  27.57 
 
 
429 aa  155  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  29.49 
 
 
425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  28.9 
 
 
425 aa  138  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.43 
 
 
366 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  34.62 
 
 
445 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  31.93 
 
 
432 aa  106  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.06 
 
 
502 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.58 
 
 
424 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  32.43 
 
 
408 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  32.52 
 
 
418 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  31.12 
 
 
399 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.18 
 
 
410 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.91 
 
 
448 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.84 
 
 
424 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.84 
 
 
424 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  29.33 
 
 
428 aa  92.8  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.84 
 
 
424 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  30 
 
 
411 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.72 
 
 
410 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.76 
 
 
408 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.47 
 
 
472 aa  84  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  30.36 
 
 
428 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  29.82 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.65 
 
 
367 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0474  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.99 
 
 
367 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1200  glutamate--cysteine ligase, GCS2  25.9 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.827115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  30 
 
 
382 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.18 
 
 
409 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  26.42 
 
 
383 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>