95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5994 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  76.32 
 
 		 456 aa  679    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  76.32 
 
 		 455 aa  650    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  100 
 
 		 455 aa  902    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  89.45 
 
 		 455 aa  749    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  76.54 
 
 		 456 aa  680    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  76.54 
 
 		 456 aa  677    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  65.79 
 
 		 456 aa  596  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  63.86 
 
 		 460 aa  583  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  62.72 
 
 		 456 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  62.06 
 
 		 456 aa  568  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  62.06 
 
 		 456 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  63.04 
 
 		 460 aa  567  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  62.72 
 
 		 456 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  60.96 
 
 		 456 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  61.62 
 
 		 456 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  60.53 
 
 		 456 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  57.52 
 
 		 457 aa  515  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  58.9 
 
 		 457 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  56.96 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  57.37 
 
 		 456 aa  506  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  56.54 
 
 		 457 aa  501  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  57.71 
 
 		 456 aa  502  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  57.36 
 
 		 457 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  56.74 
 
 		 457 aa  494  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  58.33 
 
 		 457 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  58.77 
 
 		 457 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  55.48 
 
 		 454 aa  482  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  56.47 
 
 		 454 aa  482  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  55.48 
 
 		 454 aa  481  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  56.03 
 
 		 454 aa  475  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  54.15 
 
 		 456 aa  477  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  55.7 
 
 		 452 aa  471  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  56.46 
 
 		 457 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  58.39 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  53.36 
 
 		 459 aa  468  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  57.49 
 
 		 457 aa  467  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  51.55 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  55.01 
 
 		 455 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  52.54 
 
 		 456 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  53.22 
 
 		 454 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  57.05 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  52.81 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  52.85 
 
 		 454 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  56.14 
 
 		 458 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  55.03 
 
 		 460 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  54.84 
 
 		 470 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  52.63 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  47.42 
 
 		 465 aa  408  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  46.73 
 
 		 484 aa  391  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  46.29 
 
 		 393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  44.16 
 
 		 453 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  45.37 
 
 		 453 aa  329  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  44.98 
 
 		 453 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  45.37 
 
 		 453 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  39.59 
 
 		 451 aa  269  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  38.08 
 
 		 462 aa  264  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  28.91 
 
 		 443 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  30.73 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  31.24 
 
 		 427 aa  172  7.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  30.32 
 
 		 429 aa  159  8e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  33.13 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  26.93 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  34.28 
 
 		 432 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.9 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  33.78 
 
 		 408 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  37.3 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.21 
 
 		 424 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.21 
 
 		 424 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.21 
 
 		 424 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.96 
 
 		 424 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  34.82 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  34.09 
 
 		 502 aa  100  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  34.44 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.27 
 
 		 408 aa  96.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.58 
 
 		 411 aa  93.6  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  33.83 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 		 472 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  33.47 
 
 		 428 aa  90.5  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.83 
 
 		 448 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  30.48 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.59 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.3 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.47 
 
 		 384 aa  57  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  32.93 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.81 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  29.11 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0474  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.81 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  28.87 
 
 		 383 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.39 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.86 
 
 		 409 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1200  glutamate--cysteine ligase, GCS2  24.8 
 
 		 367 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.827115  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  30.1 
 
 		 850 aa  43.5  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.3 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  29.27 
 
 		 385 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  28.23 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>