87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0332 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  100 
 
 
408 aa  804    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  64.9 
 
 
373 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  45.57 
 
 
502 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  48.85 
 
 
428 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  48.48 
 
 
399 aa  270  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.75 
 
 
472 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  41.81 
 
 
432 aa  229  5e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  44.55 
 
 
424 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  48.63 
 
 
418 aa  221  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.44 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  44.33 
 
 
424 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  44.33 
 
 
424 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  44.33 
 
 
424 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.91 
 
 
408 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  42.25 
 
 
410 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  40.2 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  42.12 
 
 
448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  42.28 
 
 
445 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.13 
 
 
366 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.02 
 
 
410 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  31.88 
 
 
456 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  32.51 
 
 
456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  30.16 
 
 
456 aa  126  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  29.56 
 
 
456 aa  126  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  34.27 
 
 
456 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  31.69 
 
 
456 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  36.12 
 
 
456 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  30.33 
 
 
456 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  31.97 
 
 
462 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  33.96 
 
 
456 aa  124  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  30.45 
 
 
459 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  30.05 
 
 
456 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  36.43 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  30.25 
 
 
456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  38.62 
 
 
455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  35.54 
 
 
456 aa  116  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  30.11 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  32.97 
 
 
456 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  37.25 
 
 
455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  35.68 
 
 
454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  35.68 
 
 
454 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  29.97 
 
 
457 aa  113  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  32.87 
 
 
454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  32.67 
 
 
460 aa  110  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  34.3 
 
 
455 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  31.72 
 
 
460 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  33.82 
 
 
453 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  29.78 
 
 
456 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  31.77 
 
 
456 aa  107  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  30.11 
 
 
455 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  28.75 
 
 
484 aa  103  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  32.56 
 
 
454 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  35.91 
 
 
453 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  28.87 
 
 
465 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  32.43 
 
 
457 aa  100  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  27.93 
 
 
457 aa  99.4  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  35.57 
 
 
453 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  34.8 
 
 
458 aa  99  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  28.3 
 
 
454 aa  98.2  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  29.88 
 
 
457 aa  97.4  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  35.11 
 
 
470 aa  97.4  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  34.25 
 
 
453 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  29.17 
 
 
452 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  31.96 
 
 
454 aa  93.2  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  28.91 
 
 
457 aa  93.2  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  28.91 
 
 
457 aa  93.2  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  30.45 
 
 
454 aa  92.8  9e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  32.13 
 
 
457 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  30.06 
 
 
460 aa  90.5  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  27.86 
 
 
457 aa  89.7  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  28.21 
 
 
432 aa  87.4  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  31.43 
 
 
457 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  31.59 
 
 
457 aa  86.3  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  30.74 
 
 
457 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  30.19 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  33.61 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  32.7 
 
 
427 aa  82.8  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  26.28 
 
 
443 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  29.97 
 
 
429 aa  72.4  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  26.44 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  29.29 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  29.61 
 
 
425 aa  66.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.9 
 
 
409 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  27.46 
 
 
359 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1784  hypothetical protein  62.07 
 
 
162 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.61 
 
 
366 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.23 
 
 
390 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>