93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1082 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  100 
 
 
445 aa  878    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  47.77 
 
 
399 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  42.25 
 
 
428 aa  239  9e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.46 
 
 
408 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  42.65 
 
 
432 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.33 
 
 
366 aa  229  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.33 
 
 
411 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  42.62 
 
 
428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  44.13 
 
 
410 aa  225  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  43.48 
 
 
502 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  42.72 
 
 
424 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  42.11 
 
 
448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  42.75 
 
 
424 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  42.75 
 
 
424 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  42.75 
 
 
424 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.21 
 
 
472 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  43.04 
 
 
408 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  45.11 
 
 
418 aa  199  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.21 
 
 
410 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  43.54 
 
 
373 aa  194  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  32.78 
 
 
456 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  32.49 
 
 
456 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  33.14 
 
 
462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  31.89 
 
 
459 aa  133  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  33.64 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  33.22 
 
 
456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  31.13 
 
 
456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  33.22 
 
 
456 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  34.29 
 
 
460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  33.11 
 
 
456 aa  126  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  32.8 
 
 
457 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  30.9 
 
 
457 aa  125  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  31.83 
 
 
456 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  33.13 
 
 
456 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  30.77 
 
 
484 aa  124  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  34.62 
 
 
457 aa  123  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  33.99 
 
 
456 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  30.62 
 
 
457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  37.41 
 
 
456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  29.83 
 
 
456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  31.52 
 
 
457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  33.99 
 
 
456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  33.07 
 
 
457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  31.52 
 
 
457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  36.9 
 
 
456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  36.9 
 
 
456 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  31.83 
 
 
454 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  32.29 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  34.47 
 
 
465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  31.64 
 
 
454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.71 
 
 
453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  30.29 
 
 
457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  33.2 
 
 
454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  33.72 
 
 
453 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  35.21 
 
 
455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  29.7 
 
 
457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  34.1 
 
 
453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  31.14 
 
 
453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  30.9 
 
 
451 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  31.91 
 
 
457 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  32.71 
 
 
456 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  38.02 
 
 
455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  37.3 
 
 
455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  34.41 
 
 
470 aa  111  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  31.62 
 
 
456 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  31.53 
 
 
460 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  30.57 
 
 
455 aa  109  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  30.49 
 
 
455 aa  107  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  31.99 
 
 
454 aa  106  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  32.96 
 
 
457 aa  103  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  31.01 
 
 
452 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  29.27 
 
 
454 aa  100  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  29.27 
 
 
454 aa  100  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  33.86 
 
 
458 aa  99.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  29.58 
 
 
454 aa  96.7  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  23.81 
 
 
432 aa  92.4  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  28.27 
 
 
427 aa  90.9  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  27.44 
 
 
425 aa  89.4  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  30.5 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  24.62 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  22.97 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  26.88 
 
 
429 aa  72.8  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1463  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.55 
 
 
311 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.800813  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1784  hypothetical protein  68.75 
 
 
162 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  30.59 
 
 
363 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  30.92 
 
 
376 aa  46.6  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  27.74 
 
 
376 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  27.74 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  30.18 
 
 
364 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  27.74 
 
 
376 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  30.18 
 
 
364 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.23 
 
 
373 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.41 
 
 
386 aa  43.9  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>