96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0570 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  100 
 
 
456 aa  936    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  64.62 
 
 
456 aa  613  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  64.52 
 
 
454 aa  597  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  64.75 
 
 
454 aa  592  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  61.98 
 
 
455 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  61.42 
 
 
454 aa  566  1e-160  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  61.42 
 
 
454 aa  565  1e-160  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  59.91 
 
 
457 aa  563  1.0000000000000001e-159  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  62.67 
 
 
460 aa  559  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  64.16 
 
 
455 aa  560  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  60.72 
 
 
457 aa  544  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  60.27 
 
 
456 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  61.63 
 
 
456 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  59.91 
 
 
456 aa  541  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  58.78 
 
 
456 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  58.33 
 
 
456 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  58.78 
 
 
456 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  57.6 
 
 
456 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  57.66 
 
 
456 aa  522  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  56.76 
 
 
456 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  58.78 
 
 
456 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  55.88 
 
 
459 aa  510  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  58.5 
 
 
452 aa  505  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  54.61 
 
 
456 aa  504  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  54.48 
 
 
457 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  55.56 
 
 
456 aa  497  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  56.39 
 
 
460 aa  488  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  55.95 
 
 
456 aa  487  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  55.73 
 
 
456 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  55.95 
 
 
456 aa  487  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  54.42 
 
 
454 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  53.61 
 
 
457 aa  484  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  53.61 
 
 
457 aa  483  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  53.76 
 
 
460 aa  480  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  56.18 
 
 
457 aa  480  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  56.88 
 
 
455 aa  478  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  53.85 
 
 
457 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  57.71 
 
 
455 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  54.88 
 
 
454 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  51.92 
 
 
457 aa  464  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  53.93 
 
 
457 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  53.71 
 
 
457 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  51.9 
 
 
465 aa  455  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  54.88 
 
 
454 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  56.17 
 
 
455 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  51.75 
 
 
393 aa  437  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  50.22 
 
 
457 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  52.76 
 
 
458 aa  425  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  49.89 
 
 
484 aa  424  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  49.44 
 
 
470 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  40.68 
 
 
453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  40.91 
 
 
453 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  40.68 
 
 
453 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  40 
 
 
453 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  39.54 
 
 
451 aa  276  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  37.09 
 
 
462 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  29.33 
 
 
443 aa  177  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  31.37 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  35.91 
 
 
429 aa  173  5e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  25.23 
 
 
432 aa  162  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  28.93 
 
 
427 aa  144  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  25.33 
 
 
425 aa  123  7e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  29.91 
 
 
432 aa  112  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.23 
 
 
424 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.42 
 
 
424 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.42 
 
 
424 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.42 
 
 
424 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  33.2 
 
 
445 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.74 
 
 
410 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  33.87 
 
 
408 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.7 
 
 
472 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  32.45 
 
 
418 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.38 
 
 
502 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.82 
 
 
411 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.93 
 
 
448 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  31.1 
 
 
399 aa  97.8  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.27 
 
 
366 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  30.33 
 
 
428 aa  91.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.78 
 
 
410 aa  90.5  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.86 
 
 
408 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  32.17 
 
 
373 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  28.34 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  28.06 
 
 
378 aa  53.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.54 
 
 
388 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  29.09 
 
 
366 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  28.92 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.63 
 
 
378 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  27.47 
 
 
390 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.93 
 
 
374 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  26.7 
 
 
379 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.75 
 
 
372 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  27.07 
 
 
385 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.82 
 
 
389 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  25.71 
 
 
410 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.57 
 
 
374 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  32.04 
 
 
850 aa  43.1  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>