83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2113 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  100 
 
 		 410 aa  800    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  88.97 
 
 		 411 aa  694    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  48.85 
 
 		 408 aa  338  8e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  50.26 
 
 		 428 aa  326  6e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  50.42 
 
 		 410 aa  319  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  45.27 
 
 		 399 aa  256  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  42.18 
 
 		 428 aa  239  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  42.25 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.03 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  43.17 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  43.72 
 
 		 373 aa  201  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  40 
 
 		 424 aa  190  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  43.84 
 
 		 418 aa  189  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  42.5 
 
 		 502 aa  186  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.02 
 
 		 472 aa  186  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  37.34 
 
 		 432 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  38.3 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  37.01 
 
 		 424 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  37.01 
 
 		 424 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  37.01 
 
 		 424 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  31.29 
 
 		 456 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  30.72 
 
 		 456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  30.03 
 
 		 456 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  31.03 
 
 		 456 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  29.88 
 
 		 456 aa  120  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  31.17 
 
 		 456 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  31.4 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  32.52 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  32.12 
 
 		 459 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  28.92 
 
 		 456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  29.56 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  34.66 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  33.33 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  33.33 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  31.83 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  28.36 
 
 		 484 aa  114  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  30.45 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  30.06 
 
 		 455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  30.57 
 
 		 456 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  30.79 
 
 		 456 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  31.01 
 
 		 456 aa  112  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  32.18 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  31.78 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  30.11 
 
 		 460 aa  110  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  29.39 
 
 		 456 aa  110  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.46 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  29.53 
 
 		 465 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  30.14 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  27.2 
 
 		 457 aa  106  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  32.82 
 
 		 462 aa  106  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  32.06 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  30.9 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  30.27 
 
 		 454 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  28.43 
 
 		 455 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  30.74 
 
 		 456 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  29.58 
 
 		 456 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  29.04 
 
 		 454 aa  103  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  29.82 
 
 		 456 aa  103  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  34.55 
 
 		 455 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  30.25 
 
 		 457 aa  103  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  28.92 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  30.16 
 
 		 457 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  28.74 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  31.8 
 
 		 453 aa  99.4  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  29.08 
 
 		 457 aa  97.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  30.28 
 
 		 457 aa  96.7  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  30.28 
 
 		 457 aa  96.3  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  31.08 
 
 		 457 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  30.32 
 
 		 458 aa  94.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  30.98 
 
 		 457 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  31.87 
 
 		 457 aa  93.2  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  27.59 
 
 		 457 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  32.1 
 
 		 455 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  31.98 
 
 		 470 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  33.33 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  21.77 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  24.53 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  27.17 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  24.93 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  24.68 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  25.71 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  26.2 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1784  hypothetical protein  65.62 
 
 		 162 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>