90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0828 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  76.97 
 
 		 455 aa  641    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  94.74 
 
 		 456 aa  860    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  100 
 
 		 456 aa  921    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  76.54 
 
 		 455 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  81.58 
 
 		 455 aa  711    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  94.3 
 
 		 456 aa  856    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  65.35 
 
 		 456 aa  606  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  64.3 
 
 		 460 aa  592  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  63.99 
 
 		 460 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  62.94 
 
 		 456 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  62.5 
 
 		 456 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  62.72 
 
 		 456 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  62.28 
 
 		 456 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  61.84 
 
 		 456 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  61.62 
 
 		 456 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  61.4 
 
 		 456 aa  571  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  57.59 
 
 		 456 aa  521  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  56.89 
 
 		 457 aa  518  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  57.3 
 
 		 457 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  56.86 
 
 		 457 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  55.8 
 
 		 457 aa  511  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  57.08 
 
 		 457 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  56.46 
 
 		 457 aa  504  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  55.95 
 
 		 456 aa  498  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  55.76 
 
 		 454 aa  494  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  54.3 
 
 		 457 aa  493  9.999999999999999e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  56.32 
 
 		 452 aa  492  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  56.64 
 
 		 457 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  55.97 
 
 		 457 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  56.64 
 
 		 457 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  55.08 
 
 		 454 aa  481  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  53.05 
 
 		 454 aa  479  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  52.57 
 
 		 454 aa  480  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  55.88 
 
 		 455 aa  473  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  51.75 
 
 		 456 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  56.82 
 
 		 455 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  56.15 
 
 		 460 aa  461  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  52.65 
 
 		 459 aa  463  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  56.02 
 
 		 457 aa  461  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  52.97 
 
 		 454 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  55.93 
 
 		 456 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  52.19 
 
 		 454 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  49.56 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  50.67 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  54.4 
 
 		 458 aa  433  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  48.2 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  52.19 
 
 		 454 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  53.58 
 
 		 470 aa  413  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  46.73 
 
 		 484 aa  393  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  45.7 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  45.18 
 
 		 453 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  45.31 
 
 		 453 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  45.18 
 
 		 453 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  44.42 
 
 		 453 aa  342  9e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  37.64 
 
 		 462 aa  278  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  40.09 
 
 		 451 aa  272  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  28.91 
 
 		 443 aa  173  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  34.55 
 
 		 429 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  29.19 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  29.26 
 
 		 427 aa  159  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  29.57 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  32.42 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  31.49 
 
 		 432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  35.23 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.43 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  38.52 
 
 		 445 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.03 
 
 		 424 aa  103  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.9 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.42 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.42 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.42 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  32.44 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  34.63 
 
 		 502 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  31.37 
 
 		 418 aa  96.7  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.32 
 
 		 472 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.27 
 
 		 448 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.34 
 
 		 366 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.56 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  30.77 
 
 		 428 aa  86.3  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  32.09 
 
 		 373 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  31.25 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.04 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.13 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  27.39 
 
 		 383 aa  47  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  32.5 
 
 		 382 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  29.68 
 
 		 383 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  25 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.59 
 
 		 378 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.96 
 
 		 367 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0474  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.96 
 
 		 367 aa  43.5  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>