95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04428 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  86.78 
 
 		 454 aa  827    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  100 
 
 		 454 aa  933    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  77.31 
 
 		 454 aa  744    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  77.31 
 
 		 454 aa  741    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  64.75 
 
 		 456 aa  592  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  62.42 
 
 		 456 aa  584  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  65.79 
 
 		 393 aa  565  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  63.51 
 
 		 460 aa  560  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  59.34 
 
 		 455 aa  558  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  62.17 
 
 		 455 aa  552  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  60.67 
 
 		 457 aa  552  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  63.84 
 
 		 456 aa  551  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  62.56 
 
 		 452 aa  545  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  61.35 
 
 		 457 aa  546  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  58.26 
 
 		 459 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  58.35 
 
 		 456 aa  525  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  58.13 
 
 		 456 aa  525  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  56.47 
 
 		 456 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  56.7 
 
 		 456 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  55.48 
 
 		 456 aa  505  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  57.37 
 
 		 456 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  57.94 
 
 		 454 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  54.91 
 
 		 456 aa  501  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  54.91 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  54.69 
 
 		 456 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  54.91 
 
 		 456 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  54.69 
 
 		 456 aa  491  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  57.27 
 
 		 454 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  53.15 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  52 
 
 		 457 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  55.08 
 
 		 456 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  53.95 
 
 		 460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  52.86 
 
 		 457 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  56.15 
 
 		 455 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  54.63 
 
 		 456 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  54.18 
 
 		 456 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  52.22 
 
 		 457 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  57.05 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  52.22 
 
 		 457 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  50 
 
 		 457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  52.99 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  52.68 
 
 		 457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  51.88 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  56.03 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  51.75 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  52.03 
 
 		 470 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  50.57 
 
 		 484 aa  432  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  55.76 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  50.33 
 
 		 460 aa  430  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  50 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  40.63 
 
 		 453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  39.73 
 
 		 453 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  40.77 
 
 		 453 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  40.77 
 
 		 453 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  41.49 
 
 		 451 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  38.08 
 
 		 462 aa  270  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  34.82 
 
 		 443 aa  206  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  26.86 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  29.28 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  29.25 
 
 		 429 aa  150  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  28.61 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  25.84 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  32.62 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.33 
 
 		 502 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.27 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  28.49 
 
 		 432 aa  103  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.82 
 
 		 472 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.01 
 
 		 411 aa  101  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  32.2 
 
 		 399 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  31.38 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  32.56 
 
 		 408 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.45 
 
 		 366 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  27.12 
 
 		 424 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  27.12 
 
 		 424 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.27 
 
 		 424 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  27.12 
 
 		 424 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  31.45 
 
 		 445 aa  93.2  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.76 
 
 		 448 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  29.62 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.95 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.52 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  30.47 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.03 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.62 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  28.4 
 
 		 382 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.77 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.89 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.84 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1200  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.42 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.827115  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 		 374 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  28.48 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.27 
 
 		 372 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.73 
 
 		 386 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0474  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.66 
 
 		 367 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  27.46 
 
 		 390 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>