85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4511 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  100 
 
 		 502 aa  1001    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  54.66 
 
 		 472 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  47.43 
 
 		 399 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  46.31 
 
 		 408 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  44.61 
 
 		 428 aa  256  9e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  45.58 
 
 		 432 aa  252  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  44.5 
 
 		 373 aa  239  9e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  43.84 
 
 		 424 aa  237  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  44.23 
 
 		 448 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  47.14 
 
 		 424 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  47.14 
 
 		 424 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  47.14 
 
 		 424 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  43.58 
 
 		 418 aa  224  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.36 
 
 		 411 aa  190  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.64 
 
 		 408 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  40.73 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  44 
 
 		 445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  39.57 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.61 
 
 		 366 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.5 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  30.97 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  30.95 
 
 		 456 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  32.27 
 
 		 456 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  31.4 
 
 		 456 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  30.46 
 
 		 459 aa  120  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  31.12 
 
 		 456 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  31.94 
 
 		 456 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  29.33 
 
 		 456 aa  118  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  30.21 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  33.55 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  29.9 
 
 		 456 aa  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  31.76 
 
 		 456 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  35.23 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  34.87 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  32.25 
 
 		 454 aa  108  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  30.79 
 
 		 454 aa  108  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  31.66 
 
 		 454 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  28.69 
 
 		 456 aa  108  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  30.83 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  34.36 
 
 		 460 aa  105  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  28.38 
 
 		 456 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  30.16 
 
 		 484 aa  103  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  29.91 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  31.33 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  29.27 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  29.95 
 
 		 462 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  30.16 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  34.81 
 
 		 455 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  34.87 
 
 		 456 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  30.16 
 
 		 457 aa  99.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  30.61 
 
 		 456 aa  98.6  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  31.75 
 
 		 455 aa  99  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  34.07 
 
 		 456 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  28.4 
 
 		 457 aa  97.4  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  29.52 
 
 		 457 aa  97.1  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  31.38 
 
 		 460 aa  96.7  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  33.7 
 
 		 456 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  31.89 
 
 		 453 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  31.64 
 
 		 457 aa  95.9  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  31.99 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  31.11 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  31.83 
 
 		 458 aa  92.8  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  33.86 
 
 		 455 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  29.16 
 
 		 460 aa  93.2  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  33.79 
 
 		 455 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  32.43 
 
 		 470 aa  90.9  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.26 
 
 		 453 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  24.01 
 
 		 432 aa  90.5  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  31.45 
 
 		 452 aa  90.5  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  30.37 
 
 		 457 aa  89.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  31.36 
 
 		 457 aa  89  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  31.89 
 
 		 453 aa  87  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  30.16 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  29.53 
 
 		 465 aa  85.1  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  30.03 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  28.02 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  27.57 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  30.04 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  33.53 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  24.32 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  25.19 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  25.78 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1463  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.6 
 
 		 311 aa  52  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.800813  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1784  hypothetical protein  65.62 
 
 		 162 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.32 
 
 		 409 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>