121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3076 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  77.85 
 
 		 456 aa  762    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  100 
 
 		 456 aa  941    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  76.47 
 
 		 459 aa  729    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  71.05 
 
 		 454 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  71.27 
 
 		 454 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  79.82 
 
 		 456 aa  773    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  71.27 
 
 		 454 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  61.3 
 
 		 456 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  57.93 
 
 		 457 aa  544  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  58.61 
 
 		 454 aa  535  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  57.6 
 
 		 456 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  56.57 
 
 		 456 aa  527  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  58.13 
 
 		 454 aa  525  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  60.4 
 
 		 457 aa  520  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  54.34 
 
 		 456 aa  513  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  59.96 
 
 		 460 aa  513  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  55.33 
 
 		 455 aa  511  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  55.01 
 
 		 456 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  54.12 
 
 		 456 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  54.12 
 
 		 456 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  53.9 
 
 		 456 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  56.82 
 
 		 454 aa  507  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  56.15 
 
 		 454 aa  502  1e-141  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  53.12 
 
 		 456 aa  498  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  53.45 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  57.72 
 
 		 456 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  55.91 
 
 		 452 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  55.38 
 
 		 455 aa  490  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  51.45 
 
 		 457 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  50.67 
 
 		 457 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  53.5 
 
 		 460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  50.88 
 
 		 457 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  50.79 
 
 		 465 aa  461  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  50.66 
 
 		 457 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  51.33 
 
 		 457 aa  455  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  51.43 
 
 		 457 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  51.43 
 
 		 457 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  50.87 
 
 		 460 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  49.01 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  49.08 
 
 		 484 aa  437  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  45.53 
 
 		 457 aa  434  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  50.67 
 
 		 456 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  49.13 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  52.64 
 
 		 455 aa  425  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  50.45 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  52.18 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  52.54 
 
 		 455 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  51.6 
 
 		 458 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  45.63 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  46.62 
 
 		 470 aa  371  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  41.38 
 
 		 453 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  41.15 
 
 		 453 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  40.69 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  39.63 
 
 		 453 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  39.6 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  35.76 
 
 		 462 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  29.55 
 
 		 443 aa  194  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  28.51 
 
 		 432 aa  187  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  33.43 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  30.1 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  28.61 
 
 		 427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  29.24 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  28.25 
 
 		 432 aa  127  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  31.66 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.31 
 
 		 424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  33.99 
 
 		 445 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.27 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.27 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.27 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.76 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.95 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.38 
 
 		 502 aa  104  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  33.61 
 
 		 408 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.82 
 
 		 410 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  33.08 
 
 		 418 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.17 
 
 		 411 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.5 
 
 		 472 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  29.58 
 
 		 428 aa  92.8  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  32.16 
 
 		 373 aa  89.7  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.18 
 
 		 410 aa  87  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.72 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  28.57 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.63 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  26.83 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.66 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  28.12 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  32.56 
 
 		 382 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.95 
 
 		 372 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.5 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.66 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  29.38 
 
 		 383 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.19 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.37 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.74 
 
 		 366 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  27.46 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.93 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  29.25 
 
 		 380 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.12 
 
 		 367 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  25.48 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  28.17 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>