90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0387 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  80.31 
 
 		 457 aa  760    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  70.68 
 
 		 457 aa  668    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  74.18 
 
 		 457 aa  707    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  100 
 
 		 457 aa  949    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  73.09 
 
 		 457 aa  713    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  74.4 
 
 		 457 aa  710    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  80.74 
 
 		 457 aa  764    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  71.77 
 
 		 457 aa  693    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  63.24 
 
 		 457 aa  613  9.999999999999999e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  59.13 
 
 		 456 aa  547  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  57.33 
 
 		 456 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  57.39 
 
 		 456 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  56.74 
 
 		 456 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  56.74 
 
 		 456 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  56.74 
 
 		 456 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  56.46 
 
 		 456 aa  524  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  55.23 
 
 		 456 aa  512  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  55 
 
 		 456 aa  514  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  57.08 
 
 		 456 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  57.3 
 
 		 456 aa  504  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  56.24 
 
 		 456 aa  500  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  53.9 
 
 		 457 aa  495  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  55.09 
 
 		 460 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  58.9 
 
 		 455 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  55.01 
 
 		 454 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  55.58 
 
 		 455 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  53.25 
 
 		 460 aa  481  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  51.75 
 
 		 459 aa  478  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  56.03 
 
 		 455 aa  475  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  50.99 
 
 		 456 aa  477  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  52.86 
 
 		 454 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  53.85 
 
 		 456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  50.67 
 
 		 456 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  54.78 
 
 		 455 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  58.46 
 
 		 455 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  50.44 
 
 		 454 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  50.22 
 
 		 456 aa  461  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  52 
 
 		 454 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  52.17 
 
 		 452 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  51.56 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  54.24 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  49.67 
 
 		 454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  53.9 
 
 		 457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  49.01 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  51.79 
 
 		 460 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  48.88 
 
 		 454 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  50.88 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  47.14 
 
 		 484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  49.67 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  43.36 
 
 		 393 aa  348  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  40.82 
 
 		 453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  40.96 
 
 		 453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  40.59 
 
 		 453 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  39 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  37.85 
 
 		 451 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  34.44 
 
 		 462 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  27.75 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  29.31 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  29.77 
 
 		 427 aa  173  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  31.64 
 
 		 429 aa  159  7e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  27.63 
 
 		 425 aa  153  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  28.68 
 
 		 425 aa  137  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.85 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  28.76 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  31.65 
 
 		 418 aa  106  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  32.31 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.97 
 
 		 502 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  31.92 
 
 		 399 aa  100  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  30.74 
 
 		 428 aa  98.2  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.84 
 
 		 448 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.49 
 
 		 410 aa  97.1  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.45 
 
 		 424 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.77 
 
 		 424 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.77 
 
 		 424 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.77 
 
 		 424 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.23 
 
 		 411 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  31.45 
 
 		 408 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.03 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  31.73 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.57 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.57 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  28.85 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  30 
 
 		 382 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.81 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1463  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.69 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.800813  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0474  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.53 
 
 		 367 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.53 
 
 		 367 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  26.24 
 
 		 410 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  26.88 
 
 		 383 aa  43.9  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.79 
 
 		 409 aa  43.1  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>