91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0732 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  84.87 
 
 		 456 aa  810    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  85.53 
 
 		 456 aa  816    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  70.39 
 
 		 456 aa  669    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  86.18 
 
 		 456 aa  830    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  86.62 
 
 		 456 aa  827    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  85.31 
 
 		 456 aa  820    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  86.18 
 
 		 456 aa  821    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  100 
 
 		 456 aa  939    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  65.71 
 
 		 460 aa  599  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  62.69 
 
 		 460 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  62.95 
 
 		 456 aa  572  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  61.84 
 
 		 456 aa  558  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  60.96 
 
 		 456 aa  554  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  60.09 
 
 		 456 aa  548  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  57.33 
 
 		 457 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  59.08 
 
 		 457 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  57.33 
 
 		 457 aa  534  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  58.42 
 
 		 457 aa  528  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  58.42 
 
 		 457 aa  530  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  55.8 
 
 		 457 aa  522  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  56.76 
 
 		 456 aa  522  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  58.99 
 
 		 455 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  56.25 
 
 		 454 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  60.53 
 
 		 455 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  55.01 
 
 		 456 aa  509  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  57.33 
 
 		 457 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  55.8 
 
 		 457 aa  509  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  60.96 
 
 		 455 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  55.48 
 
 		 455 aa  501  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  56.67 
 
 		 457 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  54.91 
 
 		 454 aa  499  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  53.45 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  57.24 
 
 		 452 aa  497  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  56.15 
 
 		 455 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  52.57 
 
 		 454 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  52.88 
 
 		 459 aa  491  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  51.2 
 
 		 457 aa  491  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  53.54 
 
 		 454 aa  491  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  52.88 
 
 		 454 aa  485  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  56.6 
 
 		 456 aa  475  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  52.12 
 
 		 456 aa  474  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  52.13 
 
 		 454 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  54.81 
 
 		 460 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  55.03 
 
 		 457 aa  467  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  52.13 
 
 		 454 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  49.1 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  47.99 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  49.89 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  45.2 
 
 		 393 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  47.52 
 
 		 470 aa  368  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  41.3 
 
 		 453 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  40.55 
 
 		 453 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  40.77 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  40.32 
 
 		 453 aa  315  9e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  39.09 
 
 		 451 aa  279  6e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  37.87 
 
 		 462 aa  269  8e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  30.38 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  29.52 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  29.5 
 
 		 425 aa  176  7e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  30.22 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  27.32 
 
 		 427 aa  159  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  32.01 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  30.43 
 
 		 425 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  31.45 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.85 
 
 		 424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.59 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.68 
 
 		 424 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.68 
 
 		 424 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.68 
 
 		 424 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  33.78 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.45 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.45 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  30.48 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  31.79 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  29.83 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.3 
 
 		 411 aa  103  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.28 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.41 
 
 		 366 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.55 
 
 		 408 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  30.07 
 
 		 373 aa  91.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  30.04 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.99 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.93 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  30.49 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  28.48 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  24.55 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.98 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0474  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.77 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1200  glutamate--cysteine ligase, GCS2  25.98 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.827115  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  28.44 
 
 		 850 aa  43.9  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  26.58 
 
 		 383 aa  43.5  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>