21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1784 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1784  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  326  9e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  70.59 
 
 
399 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  36.3 
 
 
428 aa  51.6  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  75 
 
 
366 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  58.97 
 
 
502 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  65.62 
 
 
472 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  68.75 
 
 
445 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  52.17 
 
 
410 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  52.17 
 
 
411 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  53.19 
 
 
373 aa  48.5  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  52.17 
 
 
418 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  64.52 
 
 
424 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  64.52 
 
 
424 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  64.52 
 
 
424 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  61.29 
 
 
432 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  62.5 
 
 
448 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  62.5 
 
 
424 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  43.1 
 
 
428 aa  44.3  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.68 
 
 
410 aa  44.3  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  62.07 
 
 
408 aa  43.9  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  58.62 
 
 
408 aa  41.6  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>