18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1624 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1624  glutamate--cysteine ligase, GCS2  100 
 
 
370 aa  759    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0322257 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1693  glutamate--cysteine ligase, GCS2  56.04 
 
 
366 aa  421  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1200  glutamate--cysteine ligase, GCS2  51.79 
 
 
367 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.827115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  51.24 
 
 
367 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0474  glutamate--cysteine ligase GCS2  51.24 
 
 
367 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1422  glutamate--cysteine ligase GCS2  48.76 
 
 
367 aa  391  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5783  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.44 
 
 
420 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0909  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.2 
 
 
412 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.237663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0445  hypothetical protein  33.46 
 
 
408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0421  hypothetical protein  32.83 
 
 
408 aa  143  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1454  hypothetical protein  33.51 
 
 
410 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  31.25 
 
 
454 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.11 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  26.67 
 
 
455 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.74 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  33.82 
 
 
460 aa  43.9  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  27.68 
 
 
454 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  27.68 
 
 
454 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>