More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1834 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1834  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.567429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 214 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 214 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2774  LuxR family DNA-binding response regulator  34.21 
 
 		 216 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2279  two component LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5418  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.03 
 
 		 774 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2579  response regulator FixJ  37.27 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2491  LuxR response regulator receiver  36.05 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1632  two component LuxR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  32.4 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  33.16 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  28.28 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3745  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3918  two component LuxR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  33.86 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1614  two component LuxR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  29.89 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  37.58 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  35.62 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  35.62 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2568  response regulator protein  28.99 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0467638  hitchhiker  0.0000000292578 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.56 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  28.49 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0276  two component transcription LuxR family regulatory protein  28.67 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00306595  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  27.27 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.72 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5362  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 		 643 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.46 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4015  response regulator receiver protein  31.55 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3365  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5156  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  30.89 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  28.49 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5185  two component LuxR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6046  two component LuxR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 502 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1229  two component LuxR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4877  PAS sensor protein  32.43 
 
 		 643 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  28.49 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  28.48 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  29.41 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0872  two component LuxR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  33.55 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5318  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00034283  normal  0.590249 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3602  LuxR response regulator receiver  39.02 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.66617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  30.72 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  32.11 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4652  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.93 
 
 		 213 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0846  two component LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 209 aa  72  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0209  two component LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  31.5 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  30.6 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3697  two component LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  30.27 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.27 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  31.47 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.67 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3794  response regulator receiver protein  29.68 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  32.11 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4829  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352064  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.27 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3894  response regulator receiver protein  30.67 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.52621  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  34.06 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.34 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>