118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf162 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf162  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 297 aa  594  1e-169  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.211259  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  32.02 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0019  DNA polymerase III delta subunit  49.18 
 
 		 264 aa  55.5  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl675  DNA polymerase III delta' subunit  32.14 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.94 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  26.03 
 
 		 328 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  29.55 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  23.3 
 
 		 659 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.53 
 
 		 340 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  24.18 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  39.77 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0011  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.26 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.158279  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  30 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  25.21 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  25.21 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  28.67 
 
 		 337 aa  48.9  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  32.5 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1574  DNA polymerase III subunit delta'  31.18 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1495  DNA polymerase III subunit delta'  29.38 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0414246  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  31.43 
 
 		 600 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0932  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  24.83 
 
 		 416 aa  47.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.1978 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  24.12 
 
 		 614 aa  47.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.58 
 
 		 361 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0157  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  32.91 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0155  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  32.91 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  31.82 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  32.5 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.09 
 
 		 520 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1418  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  45.61 
 
 		 602 aa  46.6  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.733892 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0884  DNA-directed DNA polymerase  30.86 
 
 		 373 aa  46.6  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.772568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0612  DNA polymerase III delta' subunit  25.48 
 
 		 322 aa  46.6  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.25 
 
 		 347 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  24.73 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1274  DNA polymerase III subunit delta'  29.11 
 
 		 383 aa  46.2  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4439  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.1 
 
 		 730 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  23.95 
 
 		 652 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  30.26 
 
 		 360 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  44.26 
 
 		 629 aa  46.2  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.28 
 
 		 650 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  29.63 
 
 		 343 aa  45.8  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  23.65 
 
 		 373 aa  45.8  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  20.34 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0076  ATPase  29.38 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  25.44 
 
 		 650 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.92 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2290  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  22.5 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.33 
 
 		 496 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.11 
 
 		 569 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  34.55 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  22.64 
 
 		 560 aa  45.4  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  30.26 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.46 
 
 		 322 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  30.77 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.66 
 
 		 561 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0122  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  29.01 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  26.21 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4930  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.72 
 
 		 621 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522711  normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  32.91 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  26.21 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.52 
 
 		 695 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0446  DNA polymerase III subunit delta'  24.67 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0505  DNA-directed DNA polymerase  32 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.77 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0518  DNA-directed DNA polymerase  32 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0375901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  32.14 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  36.73 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2074  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.64 
 
 		 648 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.86 
 
 		 634 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.07 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  30.36 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.16 
 
 		 567 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  25.61 
 
 		 499 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.19 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  30.77 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.67 
 
 		 575 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.86 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.75 
 
 		 447 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  36.21 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.92 
 
 		 663 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4101  DNA polymerase III subunit delta'  36.73 
 
 		 346 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2647  DNA-directed DNA polymerase  30.59 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.11798 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  25.81 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  25.81 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.64 
 
 		 324 aa  43.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.11 
 
 		 395 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  34.69 
 
 		 323 aa  43.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  25.81 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0411  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  29.32 
 
 		 272 aa  43.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1535  putative DNA polymerase III delta prime subunit  32.14 
 
 		 372 aa  43.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3115  DNA polymerase III subunit delta'  34.69 
 
 		 351 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0432076  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  33.33 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.12 
 
 		 613 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1971  DNA polymerase III domain-containing protein  34.92 
 
 		 429 aa  42.7  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  23.65 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.6 
 
 		 559 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0796  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.99 
 
 		 565 aa  42.7  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0281  DNA polymerase III, delta prime subunit  25 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0965  DNA-directed DNA polymerase  27.01 
 
 		 377 aa  42.7  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.44 
 
 		 570 aa  42.7  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  22.94 
 
 		 732 aa  42.7  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0388635 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>