More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0019 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0019  DNA polymerase III delta subunit  100 
 
 		 264 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl675  DNA polymerase III delta' subunit  36.81 
 
 		 247 aa  72  0.00000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  46.84 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  46.84 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  40.62 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  45.57 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  45.57 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  45.57 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  45.57 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  45.57 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  45.57 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  45.57 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  45.57 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0011  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.09 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.158279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.13 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  33.12 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  40 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  30.93 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  31.45 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  27.22 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0256  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.23 
 
 		 651 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0966021  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1574  DNA polymerase III subunit delta'  30.61 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  29.79 
 
 		 559 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.68 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.45 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.68 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2586  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.06 
 
 		 612 aa  55.8  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0700925  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.08 
 
 		 570 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf162  DNA polymerase III subunit delta  49.18 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.211259  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  29.08 
 
 		 562 aa  55.5  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  27.53 
 
 		 382 aa  55.5  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  50 
 
 		 586 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.41 
 
 		 550 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.35 
 
 		 384 aa  55.1  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 		 398 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.561354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.99 
 
 		 610 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1470  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 		 617 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0928579  normal  0.923251 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  50 
 
 		 584 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0274  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.95 
 
 		 628 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0435  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.3 
 
 		 606 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.853663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1652  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.8 
 
 		 397 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.675136  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.7 
 
 		 323 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  40 
 
 		 396 aa  53.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  38.6 
 
 		 396 aa  53.9  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  47.17 
 
 		 669 aa  53.5  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.14 
 
 		 496 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0055  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.63 
 
 		 582 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0628794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0505  DNA-directed DNA polymerase  37.35 
 
 		 308 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.85 
 
 		 687 aa  53.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213338 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.28 
 
 		 361 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1322  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 396 aa  53.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.403308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.28 
 
 		 588 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1622  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 		 401 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  48.15 
 
 		 579 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0518  DNA-directed DNA polymerase  37.35 
 
 		 308 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0375901  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0110  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.11 
 
 		 631 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4543  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.33 
 
 		 390 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  45.28 
 
 		 650 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0796  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.96 
 
 		 565 aa  53.1  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.17 
 
 		 695 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  45.28 
 
 		 548 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  33.75 
 
 		 336 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  30 
 
 		 390 aa  52.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.39 
 
 		 659 aa  52.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  43.4 
 
 		 600 aa  52.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0122  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  45.45 
 
 		 308 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  46.3 
 
 		 595 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  27.82 
 
 		 499 aa  52.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9220  DNA-directed DNA polymerase  32.1 
 
 		 393 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.4 
 
 		 735 aa  52.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.19 
 
 		 501 aa  52.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.23 
 
 		 343 aa  52.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.4 
 
 		 569 aa  52  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0061  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 282 aa  52  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.639704  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.23 
 
 		 602 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0330154  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4397  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.23 
 
 		 625 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.4 
 
 		 589 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.4 
 
 		 599 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0255  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.64 
 
 		 623 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0166  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.29 
 
 		 608 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4077  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.23 
 
 		 626 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  34.15 
 
 		 354 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4057  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.11 
 
 		 600 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.495634  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3432  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.23 
 
 		 625 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1614  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 334 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000870759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4955  DNA-directed DNA polymerase  26.83 
 
 		 390 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405656  normal  0.601805 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1238  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.36 
 
 		 634 aa  52  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3140  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.11 
 
 		 643 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000034955  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  45.28 
 
 		 629 aa  50.8  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  28.57 
 
 		 394 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.11 
 
 		 643 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000202258  normal  0.0671233 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.06 
 
 		 421 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0521  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.64 
 
 		 582 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.067552  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00426  hypothetical protein  32.11 
 
 		 643 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00196297  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4848  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.95 
 
 		 618 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.28 
 
 		 663 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0507  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.11 
 
 		 643 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000331221  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.51 
 
 		 602 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.23 
 
 		 602 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.330023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.37 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>