More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4077 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1238  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.22 
 
 
634 aa  637    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  63.09 
 
 
602 aa  729    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0330154  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.93 
 
 
602 aa  727    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.330023  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4077  DNA polymerase III subunits gamma and tau  100 
 
 
626 aa  1262    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0110  DNA polymerase III subunits gamma and tau  71.68 
 
 
631 aa  872    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801093  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4397  DNA polymerase III subunits gamma and tau  91.05 
 
 
625 aa  1096    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.14 
 
 
605 aa  704    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00653224  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3432  DNA polymerase III subunits gamma and tau  78.3 
 
 
625 aa  933    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4057  DNA polymerase III subunits gamma and tau  61.72 
 
 
600 aa  708    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.495634  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7346  DNA polymerase III subunits gamma and tau  54.94 
 
 
613 aa  617  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0369  DNA polymerase III subunits gamma and tau  56.6 
 
 
611 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.797615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0462  DNA polymerase III subunits gamma and tau  53.58 
 
 
615 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1861  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  54.61 
 
 
628 aa  588  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.33363  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0619  DNA polymerase III subunits gamma and tau  54.32 
 
 
623 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2196  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  55.03 
 
 
626 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1812  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  53.54 
 
 
623 aa  578  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181409  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0087  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.78 
 
 
624 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.818033  normal  0.0455941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0255  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  53.9 
 
 
623 aa  563  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0274  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51.13 
 
 
628 aa  560  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4848  DNA polymerase III subunits gamma and tau  66.58 
 
 
618 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4336  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0256  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.16 
 
 
651 aa  534  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0966021  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2168  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  68.34 
 
 
622 aa  528  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531905  normal  0.517298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0668  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.17 
 
 
627 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0650  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.91 
 
 
587 aa  508  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0107119  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4752  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  66.23 
 
 
605 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169989  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0166  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.95 
 
 
608 aa  499  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2365  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.34 
 
 
580 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0435  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.74 
 
 
606 aa  494  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.853663  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3142  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  63.64 
 
 
637 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3649  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49 
 
 
592 aa  492  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.89772  normal  0.739746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3876  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.85 
 
 
584 aa  490  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0710  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.78 
 
 
582 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2000  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.53 
 
 
614 aa  481  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  61.74 
 
 
659 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0521  DNA polymerase III subunits gamma and tau  58.33 
 
 
582 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.067552  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0055  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  59.23 
 
 
582 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0628794  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4575  DNA polymerase III subunits gamma and tau  58.95 
 
 
632 aa  428  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.42 
 
 
687 aa  420  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0213338 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0796  DNA polymerase III subunits gamma and tau  54.76 
 
 
565 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1357  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.3 
 
 
573 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0803491  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1060  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  34.7 
 
 
533 aa  324  3e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077321  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0942  DNA-directed DNA polymerase  41.22 
 
 
491 aa  317  4e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  45.04 
 
 
605 aa  313  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.18 
 
 
505 aa  313  9e-84  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.547641  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.01 
 
 
582 aa  299  8e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  42.96 
 
 
579 aa  299  9e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.94 
 
 
579 aa  299  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  45.74 
 
 
582 aa  296  8e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.96 
 
 
681 aa  295  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.36 
 
 
579 aa  294  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02443  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.2 
 
 
698 aa  294  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.65 
 
 
690 aa  294  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1826  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.8 
 
 
893 aa  293  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2361  DNA-directed DNA polymerase  43.8 
 
 
957 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832917  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.65 
 
 
582 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.31 
 
 
914 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2112  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.84 
 
 
730 aa  290  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635796  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  41.55 
 
 
955 aa  289  9e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  0.000000946714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0951  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.08 
 
 
793 aa  289  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127107  normal  0.667155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19830  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.76 
 
 
694 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.48 
 
 
551 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1793  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.55 
 
 
911 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00315607  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1599  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.78 
 
 
692 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0852408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4269  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.78 
 
 
691 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2129  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.44 
 
 
795 aa  286  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25169  normal  0.3831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1613  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.66 
 
 
637 aa  286  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000410993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1851  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.53 
 
 
793 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51542  normal  0.226661 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.94 
 
 
948 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000466847  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3834  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.27 
 
 
687 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3587  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.27 
 
 
689 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.11 
 
 
939 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44630  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.27 
 
 
701 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522569  normal  0.208913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.18 
 
 
599 aa  285  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3801  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.01 
 
 
681 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1446  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.53 
 
 
821 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223161  normal  0.14614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2647  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.91 
 
 
692 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.377545  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5128  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.53 
 
 
791 aa  283  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00417503  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.11 
 
 
921 aa  282  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000191992  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2235  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.38 
 
 
1113 aa  282  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00400296  decreased coverage  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2534  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.51 
 
 
752 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.821414  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2593  DNA-directed DNA polymerase  43.77 
 
 
529 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2206  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.53 
 
 
826 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236828  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0529  DNA-directed DNA polymerase  48.24 
 
 
696 aa  281  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000324921  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2219  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.53 
 
 
812 aa  282  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373497  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.53 
 
 
825 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1361  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.53 
 
 
825 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.926406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2373  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.53 
 
 
822 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1851  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.53 
 
 
825 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0281713  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1510  DNA polymerase III, tau subunit / DNA polymerase III, gamma subunit  42.7 
 
 
648 aa  281  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0569414  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0045  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.53 
 
 
825 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787094  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1738  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.25 
 
 
813 aa  281  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206235  normal  0.0482422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1805  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.27 
 
 
696 aa  280  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2244  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.53 
 
 
825 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748475  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1572  DNA polymerase III, tau subunit  47.04 
 
 
572 aa  280  5e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13387  hitchhiker  0.00000463974 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6252  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.98 
 
 
787 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.554361  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1765  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.25 
 
 
824 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1827  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.98 
 
 
787 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203884  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2013  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  41.27 
 
 
1002 aa  280  8e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1458  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.77 
 
 
723 aa  279  8e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1200  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.96 
 
 
667 aa  279  9e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>