More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6600 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6582  major facilitator superfamily MFS_1  87.07 
 
 		 433 aa  704    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6600  major facilitator transporter  100 
 
 		 434 aa  836    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  53.41 
 
 		 444 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1522  major facilitator superfamily metabolite (proline/betaine)/H(+) symporter  55.06 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00301403  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.86 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0930  major facilitator transporter  53.63 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0989  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.13 
 
 		 439 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6648  major facilitator superfamily MFS_1  47.63 
 
 		 433 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.674597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  43.36 
 
 		 438 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  39.8 
 
 		 438 aa  264  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  39.8 
 
 		 443 aa  263  6e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  37.32 
 
 		 432 aa  242  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  37.71 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 429 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  37.96 
 
 		 429 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 429 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 429 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 438 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  37.01 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 433 aa  232  9e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  38.52 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 		 445 aa  229  9e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  37.03 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  37.77 
 
 		 436 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  41.49 
 
 		 436 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  36.85 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  36.19 
 
 		 476 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  36.19 
 
 		 476 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  37.99 
 
 		 466 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 487 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 437 aa  223  4e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  35.13 
 
 		 437 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  37.59 
 
 		 442 aa  223  6e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 435 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  36.32 
 
 		 448 aa  222  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 444 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  36.74 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  36.71 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 444 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 445 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.38 
 
 		 433 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 		 441 aa  219  8.999999999999998e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 436 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 440 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  38.05 
 
 		 430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  38.05 
 
 		 430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  38.05 
 
 		 430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  38.05 
 
 		 430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  38.05 
 
 		 430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  35.57 
 
 		 456 aa  216  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 458 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 458 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  37.8 
 
 		 465 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 467 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  35.02 
 
 		 449 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  38 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  33.57 
 
 		 431 aa  208  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  35 
 
 		 435 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.65 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  30.42 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.63 
 
 		 435 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 426 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  30.66 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  36.3 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 452 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  33.98 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  33.98 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  33.49 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  30.09 
 
 		 436 aa  201  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  31.77 
 
 		 415 aa  199  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  33.74 
 
 		 437 aa  199  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 438 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 		 438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0464  general substrate transporter  38.98 
 
 		 436 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 441 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 425 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 457 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 427 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  30.55 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 438 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 458 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 438 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 443 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>