More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1058 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
442 aa  868    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  73.73 
 
 
441 aa  641    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  78.24 
 
 
447 aa  653    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  63.85 
 
 
438 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  63.33 
 
 
445 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  64.58 
 
 
429 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  63.85 
 
 
438 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  62.44 
 
 
432 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  61.81 
 
 
429 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  62.05 
 
 
429 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  61.47 
 
 
429 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  62.29 
 
 
429 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  60.95 
 
 
435 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  61.47 
 
 
436 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  59.68 
 
 
436 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  58.53 
 
 
466 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  61.35 
 
 
435 aa  504  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  58.53 
 
 
462 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  58.29 
 
 
459 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  62.17 
 
 
466 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  61.89 
 
 
433 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  61.65 
 
 
433 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  60.93 
 
 
436 aa  491  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  60.87 
 
 
445 aa  488  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  59.81 
 
 
445 aa  485  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  58.11 
 
 
437 aa  488  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  61.76 
 
 
436 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  60.84 
 
 
461 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  61.93 
 
 
430 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  61.93 
 
 
430 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  61.93 
 
 
430 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  61.93 
 
 
430 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  60.84 
 
 
435 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  61.52 
 
 
436 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  60.59 
 
 
458 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  60.59 
 
 
458 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  61.93 
 
 
430 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  61.52 
 
 
436 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  61.69 
 
 
465 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  57.31 
 
 
445 aa  481  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  59.17 
 
 
433 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  55.74 
 
 
435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  58.25 
 
 
442 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  58.02 
 
 
442 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  52.08 
 
 
476 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  52.08 
 
 
476 aa  434  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  52.2 
 
 
487 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  53.03 
 
 
448 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  58.06 
 
 
387 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  49.53 
 
 
437 aa  397  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  52.02 
 
 
441 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  49.41 
 
 
438 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  48.46 
 
 
438 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  52.83 
 
 
450 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  45.45 
 
 
436 aa  368  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  45.97 
 
 
436 aa  365  1e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  45.85 
 
 
436 aa  364  2e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  45.36 
 
 
436 aa  363  3e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  49.05 
 
 
441 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  45.34 
 
 
429 aa  346  4e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  49.15 
 
 
441 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  49.15 
 
 
441 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  42.89 
 
 
431 aa  328  9e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  42.34 
 
 
432 aa  323  4e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  49.15 
 
 
441 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  38.27 
 
 
438 aa  284  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  38.27 
 
 
443 aa  281  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  36.01 
 
 
415 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  36.1 
 
 
415 aa  265  8e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  40.05 
 
 
407 aa  260  4e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1521  major facilitator family transporter  34.39 
 
 
448 aa  229  5e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.537503  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  33.26 
 
 
438 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0930  major facilitator transporter  35.68 
 
 
448 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 
444 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  34.5 
 
 
482 aa  219  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  29.27 
 
 
433 aa  218  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1733  major facilitator transporter  33.09 
 
 
435 aa  218  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.32022  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  33.18 
 
 
483 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  34.52 
 
 
456 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0989  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.16 
 
 
439 aa  216  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.32 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  33.33 
 
 
485 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  33.33 
 
 
485 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 
443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  35.34 
 
 
440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  33.08 
 
 
485 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  33.08 
 
 
485 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  33.08 
 
 
485 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  33.08 
 
 
485 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  33.08 
 
 
485 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  33.08 
 
 
485 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  35.42 
 
 
440 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0593  major facilitator transporter  33.59 
 
 
457 aa  213  5.999999999999999e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.42 
 
 
440 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  33.08 
 
 
485 aa  212  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  34.08 
 
 
447 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  28.29 
 
 
433 aa  211  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  36.34 
 
 
458 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  32.79 
 
 
445 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  35.61 
 
 
444 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>