More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0989 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0989  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 
439 aa  874    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  53.07 
 
 
444 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0930  major facilitator transporter  56.46 
 
 
448 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.83 
 
 
443 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1522  major facilitator superfamily metabolite (proline/betaine)/H(+) symporter  53.56 
 
 
438 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00301403  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6582  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 
433 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6600  major facilitator transporter  49.13 
 
 
434 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  44.66 
 
 
438 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6648  major facilitator superfamily MFS_1  46.48 
 
 
433 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.674597 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  34.15 
 
 
443 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  34.15 
 
 
438 aa  255  9e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  35.01 
 
 
444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  36.58 
 
 
429 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  37.05 
 
 
429 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  36.82 
 
 
429 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  36.48 
 
 
429 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  36.58 
 
 
429 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  36.19 
 
 
425 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  36.19 
 
 
425 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  36.19 
 
 
425 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  36.19 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  36.19 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  34.84 
 
 
432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  35.07 
 
 
425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  34.07 
 
 
427 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  35.98 
 
 
445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  36.43 
 
 
425 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  35.66 
 
 
435 aa  232  9e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 
425 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.23 
 
 
433 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  34.39 
 
 
456 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.54 
 
 
425 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  34.89 
 
 
438 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  36.93 
 
 
428 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  35.71 
 
 
444 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  34.89 
 
 
438 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 
438 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  35.66 
 
 
440 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  35.09 
 
 
435 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  36.16 
 
 
442 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  36.55 
 
 
448 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  35.86 
 
 
425 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  34.15 
 
 
433 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 
445 aa  227  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  35.05 
 
 
444 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.95 
 
 
452 aa  227  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  35.05 
 
 
444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  35.29 
 
 
444 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  35.25 
 
 
428 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 
427 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  35.53 
 
 
436 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 
447 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  36.04 
 
 
428 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  36.04 
 
 
428 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 
445 aa  224  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 
425 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  35.9 
 
 
466 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 
452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  33.25 
 
 
499 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  34.39 
 
 
449 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  33.65 
 
 
445 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  32.59 
 
 
459 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  35.56 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 
438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  33.97 
 
 
467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  33.95 
 
 
436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  34.46 
 
 
431 aa  221  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 
433 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  34.06 
 
 
441 aa  221  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.52 
 
 
433 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  32.59 
 
 
462 aa  220  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  35.56 
 
 
442 aa  220  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  32.59 
 
 
466 aa  220  5e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  34.29 
 
 
458 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  34.29 
 
 
458 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  34.29 
 
 
461 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  34.3 
 
 
435 aa  219  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 
443 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  34.61 
 
 
436 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  34.21 
 
 
476 aa  217  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  34.31 
 
 
487 aa  217  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  34.61 
 
 
436 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  34.21 
 
 
476 aa  217  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  34.12 
 
 
436 aa  216  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  34.37 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 
457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  34.86 
 
 
454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  35.38 
 
 
428 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  34.72 
 
 
436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  35.03 
 
 
436 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  35.03 
 
 
436 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  35.03 
 
 
436 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  35.78 
 
 
430 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  35.78 
 
 
430 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  35.78 
 
 
430 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  35.78 
 
 
430 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  34.21 
 
 
445 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  35.78 
 
 
430 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 
445 aa  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.49 
 
 
454 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>