More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1612 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  100 
 
 		 438 aa  859    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  91.32 
 
 		 438 aa  768    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  80.66 
 
 		 450 aa  626  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  77.62 
 
 		 441 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  78.97 
 
 		 441 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  79.29 
 
 		 441 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  79.06 
 
 		 441 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  54.82 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  54.57 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  54.31 
 
 		 429 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  54.57 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  55.81 
 
 		 436 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  55.47 
 
 		 438 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  55.21 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  53.96 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  53.62 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  50.98 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  52.43 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  52.31 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  51.54 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  52.71 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  52.71 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  51.81 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  52.71 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  51.57 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  49.51 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  51.01 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  51.26 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  53.57 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  47.88 
 
 		 476 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  47.88 
 
 		 476 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  50.88 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  52.11 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  51.38 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  51.13 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  50.88 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  51.55 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  49.15 
 
 		 442 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  47.88 
 
 		 487 aa  382  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  50.63 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  45.03 
 
 		 448 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  50.63 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  51.8 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  51.8 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  49.35 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  51.8 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  51.8 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  51.8 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  47.16 
 
 		 441 aa  364  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  51.55 
 
 		 465 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  47.52 
 
 		 447 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  48.49 
 
 		 442 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  47.9 
 
 		 442 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  45.69 
 
 		 437 aa  353  4e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  41.78 
 
 		 429 aa  328  8e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  42.6 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  37.59 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  39.22 
 
 		 436 aa  319  7.999999999999999e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  37.5 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  48.3 
 
 		 387 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  45.39 
 
 		 441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  41.49 
 
 		 431 aa  300  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  39.81 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  35.86 
 
 		 415 aa  254  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  35.44 
 
 		 415 aa  253  6e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  37.82 
 
 		 443 aa  249  9e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  38.52 
 
 		 407 aa  248  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  37.82 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 461 aa  233  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 		 443 aa  223  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 447 aa  216  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1733  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 435 aa  213  7e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.32022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 443 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 433 aa  210  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  35.11 
 
 		 503 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 431 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  31.98 
 
 		 483 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  34.7 
 
 		 444 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 444 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  33.93 
 
 		 444 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  34.22 
 
 		 552 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  30.81 
 
 		 485 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 495 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  30.81 
 
 		 485 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  30.81 
 
 		 485 aa  200  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  30.81 
 
 		 485 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  30.81 
 
 		 485 aa  200  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  30.81 
 
 		 485 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  34.57 
 
 		 503 aa  200  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 444 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  30.81 
 
 		 485 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  30.81 
 
 		 485 aa  199  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  31.62 
 
 		 527 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  30.56 
 
 		 485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  31.62 
 
 		 493 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>