More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0539 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  100 
 
 		 432 aa  866    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  53.13 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  51.86 
 
 		 436 aa  433  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  51.97 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  51.74 
 
 		 436 aa  431  1e-119  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  52.52 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  51.87 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  44.37 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  43.58 
 
 		 438 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  43.22 
 
 		 429 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 445 aa  361  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  45.16 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  45.14 
 
 		 462 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  42.99 
 
 		 429 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 466 aa  358  8e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 429 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  43.35 
 
 		 438 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  42.59 
 
 		 433 aa  355  8.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  44.6 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  42.25 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  45.13 
 
 		 437 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  42.79 
 
 		 432 aa  352  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  43.09 
 
 		 436 aa  350  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  44.71 
 
 		 445 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  45.12 
 
 		 445 aa  343  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  42.34 
 
 		 442 aa  340  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  43.62 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  43.39 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  43.36 
 
 		 466 aa  333  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  43.52 
 
 		 436 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 436 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 435 aa  328  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  44.29 
 
 		 436 aa  328  9e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  42.09 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 461 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 		 437 aa  326  6e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  43.19 
 
 		 458 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  43.19 
 
 		 458 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 447 aa  323  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  39.58 
 
 		 476 aa  322  6e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  39.58 
 
 		 476 aa  322  6e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  41.63 
 
 		 448 aa  322  7e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  43.71 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  43.71 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  43.71 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  43.71 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  43.71 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 487 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  43.47 
 
 		 465 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  40.48 
 
 		 450 aa  299  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 438 aa  289  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  38.83 
 
 		 415 aa  288  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  39.81 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  38.97 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  39.44 
 
 		 441 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  39.44 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  37.14 
 
 		 415 aa  270  4e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 		 441 aa  266  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  39.16 
 
 		 407 aa  258  1e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  36.09 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 441 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  34.75 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  36.62 
 
 		 438 aa  246  6e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 438 aa  210  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  31.09 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  32.38 
 
 		 456 aa  203  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  30.27 
 
 		 444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 440 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  33.16 
 
 		 431 aa  199  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.72 
 
 		 433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 444 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  30.02 
 
 		 483 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  29.57 
 
 		 444 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  30.17 
 
 		 482 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  29.15 
 
 		 485 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 433 aa  196  6e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 438 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  28.91 
 
 		 485 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  28.91 
 
 		 485 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  28.91 
 
 		 485 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  28.91 
 
 		 485 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  28.91 
 
 		 485 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  29.06 
 
 		 485 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  29.3 
 
 		 485 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  28.91 
 
 		 485 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  30.77 
 
 		 437 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 433 aa  192  7e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 		 444 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 443 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>