More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5728 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  98.87 
 
 		 442 aa  864    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  874    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  74.45 
 
 		 435 aa  628  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  71.79 
 
 		 433 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  71.79 
 
 		 433 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  67.67 
 
 		 435 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  67.2 
 
 		 461 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  67.51 
 
 		 458 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  68.72 
 
 		 436 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  68.96 
 
 		 436 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  67.51 
 
 		 458 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  69.19 
 
 		 436 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  67.54 
 
 		 466 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  63.82 
 
 		 438 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  63.82 
 
 		 438 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  67.06 
 
 		 430 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  67.06 
 
 		 430 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  67.06 
 
 		 430 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  67.06 
 
 		 430 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  67.06 
 
 		 430 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  66.82 
 
 		 465 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  63.29 
 
 		 432 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  63.53 
 
 		 429 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  63.77 
 
 		 429 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  61.96 
 
 		 429 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  65.12 
 
 		 436 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  63.29 
 
 		 429 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  62.29 
 
 		 429 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  60.94 
 
 		 445 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  61.18 
 
 		 435 aa  519  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  63.68 
 
 		 436 aa  521  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  61.68 
 
 		 437 aa  514  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  60.8 
 
 		 436 aa  512  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  61.31 
 
 		 466 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  61.31 
 
 		 462 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  61.06 
 
 		 459 aa  497  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  57.61 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  55.4 
 
 		 435 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  58.84 
 
 		 442 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  59.38 
 
 		 445 aa  478  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  60.1 
 
 		 445 aa  477  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  61.26 
 
 		 445 aa  477  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  56.66 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  53.5 
 
 		 441 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  56.88 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  56.64 
 
 		 476 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  56.64 
 
 		 476 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  53.53 
 
 		 487 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  56.46 
 
 		 387 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  47.75 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  55.06 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  47.9 
 
 		 438 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  47.99 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  47.69 
 
 		 450 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  45.43 
 
 		 436 aa  350  3e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  45.17 
 
 		 436 aa  348  1e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  45.08 
 
 		 436 aa  348  2e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  44.65 
 
 		 436 aa  346  6e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  42.86 
 
 		 429 aa  332  1e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  47.46 
 
 		 441 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  47.43 
 
 		 441 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  46.94 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  40.89 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  41.93 
 
 		 431 aa  310  2e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  47.22 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  36.79 
 
 		 415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  35.85 
 
 		 415 aa  269  8e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  38.5 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  37.53 
 
 		 407 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  37.63 
 
 		 443 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 433 aa  237  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 443 aa  229  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.35 
 
 		 443 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 440 aa  209  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1522  major facilitator superfamily metabolite (proline/betaine)/H(+) symporter  33.89 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00301403  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0593  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6582  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 		 433 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  30.02 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  34.24 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  34.24 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  29.79 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1733  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.32022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  30.02 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 445 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  29.79 
 
 		 485 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6600  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0930  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 448 aa  200  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  29.79 
 
 		 485 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  29.79 
 
 		 485 aa  199  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  29.79 
 
 		 485 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  29.79 
 
 		 485 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  29.56 
 
 		 485 aa  199  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>