More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1000 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  98.31 
 
 
415 aa  806    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  100 
 
 
415 aa  821    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  68.98 
 
 
407 aa  518  1e-146  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  43.57 
 
 
431 aa  319  7e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  40.29 
 
 
436 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  40.77 
 
 
436 aa  311  2e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  40.29 
 
 
436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  42.06 
 
 
436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  43.15 
 
 
429 aa  296  4e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  38.7 
 
 
432 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  38.54 
 
 
429 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  38.08 
 
 
429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  37.56 
 
 
429 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  37.82 
 
 
429 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  37.84 
 
 
436 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  36.97 
 
 
435 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  36.96 
 
 
438 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  37.56 
 
 
435 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  38.33 
 
 
437 aa  280  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  36.71 
 
 
438 aa  278  9e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  38.44 
 
 
436 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  38.66 
 
 
462 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  38.66 
 
 
466 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  38.4 
 
 
459 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  37.14 
 
 
445 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  36.39 
 
 
433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  38.33 
 
 
445 aa  273  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  37.14 
 
 
429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  37.24 
 
 
476 aa  272  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  35.18 
 
 
435 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  37.24 
 
 
476 aa  272  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 
445 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  36.2 
 
 
436 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  37.72 
 
 
436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  37.62 
 
 
466 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  36.27 
 
 
442 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  37.47 
 
 
436 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  36.98 
 
 
448 aa  268  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  37.25 
 
 
435 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  36.72 
 
 
487 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  37.28 
 
 
461 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  38.65 
 
 
445 aa  266  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  38.83 
 
 
432 aa  266  5.999999999999999e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  37.01 
 
 
458 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  37.01 
 
 
458 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  37.76 
 
 
436 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  36.88 
 
 
430 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  36.88 
 
 
430 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  36.88 
 
 
430 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  36.88 
 
 
430 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  36.88 
 
 
430 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 
437 aa  261  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  36.63 
 
 
465 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 
433 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.6 
 
 
433 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 
447 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  37.5 
 
 
442 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  36.79 
 
 
442 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  34.62 
 
 
441 aa  252  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 
441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  36.15 
 
 
438 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  35.86 
 
 
438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  36.58 
 
 
450 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  35.43 
 
 
441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  35.43 
 
 
441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  33.68 
 
 
438 aa  219  7e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  35.17 
 
 
441 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  33.16 
 
 
443 aa  216  5e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  36.13 
 
 
387 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  34.64 
 
 
441 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0930  major facilitator transporter  29.79 
 
 
448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1733  major facilitator transporter  29.71 
 
 
435 aa  177  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.32022  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6600  major facilitator transporter  31.77 
 
 
434 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  30.23 
 
 
482 aa  176  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0763  major facilitator transporter  27.75 
 
 
422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000770218  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6582  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 
433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.97 
 
 
443 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  30.23 
 
 
483 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0292  hypothetical protein  30.34 
 
 
431 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1522  major facilitator superfamily metabolite (proline/betaine)/H(+) symporter  30.69 
 
 
438 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00301403  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0989  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.92 
 
 
439 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  28.3 
 
 
425 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  28.97 
 
 
485 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  27.11 
 
 
433 aa  170  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  28.46 
 
 
436 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  29.22 
 
 
485 aa  170  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  28.97 
 
 
485 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  28.97 
 
 
485 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  28.97 
 
 
485 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  28.97 
 
 
485 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  28.97 
 
 
485 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  28.37 
 
 
425 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  28.97 
 
 
485 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  27.85 
 
 
444 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  27.37 
 
 
433 aa  169  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  30.23 
 
 
435 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  28.06 
 
 
425 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  27.95 
 
 
436 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  29.43 
 
 
468 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>