More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1522 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1522  major facilitator superfamily metabolite (proline/betaine)/H(+) symporter  100 
 
 		 438 aa  872    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00301403  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  86.99 
 
 		 443 aa  754    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  92.01 
 
 		 444 aa  818    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0989  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  53.56 
 
 		 439 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6582  major facilitator superfamily MFS_1  54.35 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0930  major facilitator transporter  51.23 
 
 		 448 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6600  major facilitator transporter  53.68 
 
 		 434 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  48.06 
 
 		 438 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6648  major facilitator superfamily MFS_1  49.25 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.674597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.89 
 
 		 433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 429 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  38.82 
 
 		 444 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  36.05 
 
 		 429 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 444 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  34.17 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  35.82 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 438 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  33.33 
 
 		 443 aa  239  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  34.08 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 436 aa  236  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  33.81 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 		 438 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  34.13 
 
 		 445 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 437 aa  233  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 438 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  35.73 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 462 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  32.04 
 
 		 503 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 466 aa  229  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 445 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 459 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  35.21 
 
 		 436 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 		 445 aa  227  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  32.95 
 
 		 503 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  34.83 
 
 		 456 aa  227  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 		 445 aa  226  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 489 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  34.66 
 
 		 476 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  33.88 
 
 		 500 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 458 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.21 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  31.8 
 
 		 489 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  34.66 
 
 		 476 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  33.88 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 487 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  34 
 
 		 440 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  32.6 
 
 		 552 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  33.41 
 
 		 436 aa  223  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 467 aa  223  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 445 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 433 aa  222  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  31.55 
 
 		 493 aa  222  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  32.6 
 
 		 489 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  32.6 
 
 		 489 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 445 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  32.71 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  32.71 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  32.94 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  34.59 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  31.32 
 
 		 496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  32.71 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  32.36 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  33.18 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  33.18 
 
 		 500 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  31.79 
 
 		 527 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  35.76 
 
 		 442 aa  221  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  31.58 
 
 		 531 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  31.32 
 
 		 491 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  32.35 
 
 		 489 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 495 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  31.09 
 
 		 496 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  33.25 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  31.29 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 458 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 458 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 442 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 436 aa  216  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 436 aa  216  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  32.24 
 
 		 500 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  32.16 
 
 		 500 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  32.24 
 
 		 500 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  31.5 
 
 		 493 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  32.01 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  32.01 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>