More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0903 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  87.79 
 
 
444 aa  775    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1522  major facilitator superfamily metabolite (proline/betaine)/H(+) symporter  86.99 
 
 
438 aa  735    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00301403  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 
443 aa  879    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0989  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.83 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0930  major facilitator transporter  48.38 
 
 
448 aa  408  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  49.76 
 
 
438 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6582  major facilitator superfamily MFS_1  52.47 
 
 
433 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6600  major facilitator transporter  53 
 
 
434 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6648  major facilitator superfamily MFS_1  49.75 
 
 
433 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.674597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  37.11 
 
 
444 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  35.31 
 
 
429 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  34.55 
 
 
443 aa  249  7e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.06 
 
 
433 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  35.03 
 
 
438 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  35.9 
 
 
444 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  35.56 
 
 
429 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  35.42 
 
 
444 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  35.42 
 
 
444 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  35.31 
 
 
429 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  35.31 
 
 
429 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  37.02 
 
 
435 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  33.99 
 
 
444 aa  242  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  34.29 
 
 
436 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  36.91 
 
 
448 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  34.04 
 
 
438 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  33.49 
 
 
438 aa  239  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
438 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  36.08 
 
 
476 aa  238  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  36.08 
 
 
476 aa  238  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  35.77 
 
 
436 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  33.33 
 
 
432 aa  236  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  36.12 
 
 
487 aa  236  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 
437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  33.99 
 
 
429 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  35.13 
 
 
445 aa  233  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.25 
 
 
433 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 
433 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  35.4 
 
 
466 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 
443 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  34.1 
 
 
445 aa  230  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  32.94 
 
 
500 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  32.94 
 
 
500 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  32.94 
 
 
500 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  32.94 
 
 
500 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  32.52 
 
 
503 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 
445 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  34.67 
 
 
441 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 
445 aa  227  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  32.84 
 
 
489 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  32.84 
 
 
489 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  32.25 
 
 
462 aa  227  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  33.09 
 
 
489 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  32.25 
 
 
466 aa  227  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  35.22 
 
 
440 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  32.25 
 
 
459 aa  226  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  31.3 
 
 
503 aa  226  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  33.42 
 
 
435 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  31.85 
 
 
500 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.85 
 
 
500 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  32.2 
 
 
552 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  32.6 
 
 
489 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  31.85 
 
 
500 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  31.85 
 
 
500 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  32.2 
 
 
489 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  31.85 
 
 
500 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  31.85 
 
 
500 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  32.33 
 
 
500 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  32.24 
 
 
500 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  32.56 
 
 
500 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  31.63 
 
 
500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  31.63 
 
 
500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  33.65 
 
 
445 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  32.56 
 
 
500 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  35.32 
 
 
442 aa  223  6e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  34.6 
 
 
458 aa  222  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  33.08 
 
 
456 aa  222  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  32.59 
 
 
433 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  32.01 
 
 
436 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  30.65 
 
 
493 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  32.2 
 
 
531 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 
427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  30.88 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  35.4 
 
 
435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  31.36 
 
 
496 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  34.9 
 
 
458 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  34.9 
 
 
458 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  35.07 
 
 
436 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  34.7 
 
 
461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  34.31 
 
 
467 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  35.92 
 
 
430 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  35.92 
 
 
430 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  35.92 
 
 
430 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  35.92 
 
 
430 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  35.92 
 
 
430 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  33.89 
 
 
445 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  35.07 
 
 
436 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  30.65 
 
 
491 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  35.17 
 
 
436 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  30.88 
 
 
527 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>