More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0796 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  93.76 
 
 		 433 aa  835    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  866    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1733  major facilitator transporter  47.24 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.32022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0593  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 437 aa  270  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 435 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 429 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  33.57 
 
 		 429 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  32.2 
 
 		 432 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 429 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 462 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  31.95 
 
 		 448 aa  256  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 459 aa  255  9e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 438 aa  255  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  31.34 
 
 		 438 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  31.48 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  32.93 
 
 		 436 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 		 445 aa  247  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 433 aa  247  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 437 aa  246  6e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 435 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 435 aa  240  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  30.75 
 
 		 466 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 445 aa  236  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 487 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 435 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 436 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 458 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 458 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 461 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  30.86 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  30.34 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  30.86 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 433 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.23 
 
 		 433 aa  230  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  31 
 
 		 465 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  31 
 
 		 430 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  31 
 
 		 430 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  31 
 
 		 430 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  31 
 
 		 430 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  31 
 
 		 430 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 442 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  29.27 
 
 		 442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  30.14 
 
 		 450 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  28.84 
 
 		 436 aa  206  6e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 438 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  30.73 
 
 		 438 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  28.37 
 
 		 436 aa  202  8e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  28.14 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  31.38 
 
 		 387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 441 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  27.49 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 441 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  30.02 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  27.7 
 
 		 432 aa  182  7e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  31.07 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  28.08 
 
 		 431 aa  179  9e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  30.83 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 441 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 447 aa  170  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  27.37 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 438 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 445 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  27.16 
 
 		 429 aa  159  7e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  28.35 
 
 		 407 aa  158  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  29.07 
 
 		 444 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  26.84 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.84 
 
 		 443 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  28.34 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  30.87 
 
 		 441 aa  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  28.44 
 
 		 459 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  28.12 
 
 		 483 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 440 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  31.19 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  30.02 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1522  major facilitator superfamily metabolite (proline/betaine)/H(+) symporter  28.95 
 
 		 438 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00301403  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  27.87 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.25 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  27.87 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 458 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 452 aa  147  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  27.12 
 
 		 485 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  26.99 
 
 		 484 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>