More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0930 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0930  major facilitator transporter  100 
 
 		 448 aa  879    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0989  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.46 
 
 		 439 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  48.95 
 
 		 444 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.38 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1522  major facilitator superfamily metabolite (proline/betaine)/H(+) symporter  51.23 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00301403  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6582  major facilitator superfamily MFS_1  51.3 
 
 		 433 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6600  major facilitator transporter  53.63 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6648  major facilitator superfamily MFS_1  45.66 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.674597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  43.11 
 
 		 438 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  36.41 
 
 		 443 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  36.41 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  34.95 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.69 
 
 		 433 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  37.18 
 
 		 448 aa  229  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 429 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 435 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 487 aa  227  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 429 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  33.85 
 
 		 476 aa  226  6e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 436 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  33.85 
 
 		 476 aa  226  6e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 440 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 447 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  32.87 
 
 		 445 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 442 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 429 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  34.13 
 
 		 429 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  34 
 
 		 438 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  33.91 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  34 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 466 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  35.52 
 
 		 431 aa  219  7e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 425 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 461 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  34.81 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 459 aa  217  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 458 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 458 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 		 433 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.99 
 
 		 433 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 427 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 435 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 436 aa  216  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  36.2 
 
 		 466 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 		 445 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  34.35 
 
 		 456 aa  213  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 467 aa  213  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  33.65 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  33.76 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 444 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 435 aa  211  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 445 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 444 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 452 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 436 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  33.49 
 
 		 436 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  33 
 
 		 425 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.16 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 436 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  33.76 
 
 		 444 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  33.5 
 
 		 441 aa  206  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 428 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 438 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  34.73 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  34.73 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  34.73 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  34.73 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  34.73 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 427 aa  205  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  32.19 
 
 		 493 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.02 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 438 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  35.71 
 
 		 436 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  35.71 
 
 		 436 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  31.65 
 
 		 496 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 425 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 425 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 425 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 425 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 425 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>