More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6648 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6648  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 433 aa  847    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.674597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  71.86 
 
 		 438 aa  619  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  48.5 
 
 		 444 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.75 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1522  major facilitator superfamily metabolite (proline/betaine)/H(+) symporter  49.25 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00301403  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0989  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.48 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6582  major facilitator superfamily MFS_1  46.44 
 
 		 433 aa  349  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6600  major facilitator transporter  47.63 
 
 		 434 aa  336  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0930  major facilitator transporter  45.66 
 
 		 448 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  37.1 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  37.1 
 
 		 438 aa  257  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  35.8 
 
 		 429 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 429 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  35.44 
 
 		 432 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  33.33 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 429 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 438 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  35.41 
 
 		 444 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  33.92 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 435 aa  223  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  33.8 
 
 		 448 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.73 
 
 		 433 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 433 aa  220  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 444 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 444 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 487 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  32.3 
 
 		 442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  35.73 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  34.19 
 
 		 483 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  33.25 
 
 		 436 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  34.03 
 
 		 466 aa  216  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  34.58 
 
 		 476 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 462 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 466 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  34.58 
 
 		 476 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 		 437 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.04 
 
 		 433 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 436 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 461 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 458 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 		 445 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 458 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 427 aa  212  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  32.32 
 
 		 485 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  32.55 
 
 		 485 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  32.55 
 
 		 485 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  32.55 
 
 		 485 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  32.69 
 
 		 499 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  32.55 
 
 		 485 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  32.55 
 
 		 485 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  32.55 
 
 		 485 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 435 aa  210  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  32.27 
 
 		 427 aa  210  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  32.55 
 
 		 485 aa  209  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  32.55 
 
 		 485 aa  209  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 430 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 430 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 430 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 430 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 430 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 428 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 428 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 465 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 428 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  32.93 
 
 		 482 aa  206  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  31.93 
 
 		 456 aa  206  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 447 aa  206  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 445 aa  206  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  32.8 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 441 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 425 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 425 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 425 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 437 aa  202  8e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  32.84 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3486  General substrate transporter  33.51 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 425 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  32.58 
 
 		 436 aa  201  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  32.18 
 
 		 503 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  31.33 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 425 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0168  major facilitator family transporter  31.52 
 
 		 415 aa  199  6e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 441 aa  199  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.85 
 
 		 425 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>