More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3439 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3439  ABC transporter related protein  100 
 
 		 258 aa  510  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.25185  normal  0.025897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  44.53 
 
 		 250 aa  224  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  41.9 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  43.33 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  43.27 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  39.34 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  41.87 
 
 		 248 aa  211  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  42.45 
 
 		 248 aa  208  9e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  40.73 
 
 		 268 aa  205  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  41.39 
 
 		 260 aa  202  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  43.33 
 
 		 252 aa  201  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  38.62 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  43.8 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  43.8 
 
 		 248 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  43.8 
 
 		 248 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  43.27 
 
 		 248 aa  198  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  41.63 
 
 		 248 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  40.89 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  38.93 
 
 		 397 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  44.08 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  40.98 
 
 		 363 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  41.77 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  42.97 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  41.32 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  40.16 
 
 		 257 aa  191  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  41.94 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  42.4 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  37.55 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  42.32 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  42.23 
 
 		 263 aa  188  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  40.57 
 
 		 333 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  40.98 
 
 		 359 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  39.92 
 
 		 248 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  40.4 
 
 		 278 aa  185  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  36.97 
 
 		 244 aa  185  7e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  39 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  40.4 
 
 		 278 aa  184  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0179  ABC transporter related  37.66 
 
 		 244 aa  185  8e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  41.94 
 
 		 251 aa  184  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  39.68 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  36.97 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  40.25 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  41.35 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 246 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  40.16 
 
 		 359 aa  182  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  38.33 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  36.13 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  36.55 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  40.55 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  40.55 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  42.44 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  40.41 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  40.56 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  41.06 
 
 		 252 aa  182  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  36.55 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  40 
 
 		 278 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  39.92 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  39.48 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  39.3 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  41.49 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  38.78 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.55 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  35.83 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  40.83 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  42.52 
 
 		 267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  38.93 
 
 		 361 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  40.91 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  35.71 
 
 		 244 aa  178  5.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  39.75 
 
 		 273 aa  178  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  38.52 
 
 		 362 aa  178  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  39.11 
 
 		 248 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  39.11 
 
 		 248 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  37.05 
 
 		 282 aa  178  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  39.76 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  38.52 
 
 		 357 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  38.52 
 
 		 361 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  38.52 
 
 		 361 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  33.75 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  36.25 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  38.11 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  37.65 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  37.7 
 
 		 421 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  36.59 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  39.17 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  39.17 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  34.17 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  38.46 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  37.5 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  39.84 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.96 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  39.59 
 
 		 261 aa  175  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  36.55 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  40.66 
 
 		 281 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  36.18 
 
 		 271 aa  175  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  39.67 
 
 		 333 aa  175  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0698  ABC transporter, ATP-binding protein  37.82 
 
 		 242 aa  175  8e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  42.11 
 
 		 273 aa  174  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  35.83 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>