More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1739 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1739  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 181 aa  381  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210439  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1219  NADH dehydrogenase subunit B  86.52 
 
 		 180 aa  343  8.999999999999999e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1604  NADH dehydrogenase subunit B  85.39 
 
 		 178 aa  332  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0888  NADH dehydrogenase subunit B  77.97 
 
 		 195 aa  309  2e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.330095  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0377  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.41 
 
 		 180 aa  238  5e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0166282  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2208  NADH dehydrogenase subunit B  54.37 
 
 		 213 aa  193  9e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2045  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.53 
 
 		 196 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0111546  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3411  F420H2 dehydrogenase subunit B  38.62 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3754  NADH dehydrogenase subunit B  38.79 
 
 		 247 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651225 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03191  NADH dehydrogenase subunit B  39.31 
 
 		 252 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  43.26 
 
 		 249 aa  124  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  43.26 
 
 		 249 aa  124  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  32.95 
 
 		 246 aa  124  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  33.53 
 
 		 244 aa  124  9e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03261  NADH dehydrogenase subunit B  39.31 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3500  NADH dehydrogenase subunit B  36.2 
 
 		 240 aa  123  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.693948 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  34.97 
 
 		 244 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1859  NADH dehydrogenase subunit B  32.2 
 
 		 245 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0295  NADH dehydrogenase subunit B  38.62 
 
 		 244 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25251  NADH dehydrogenase subunit B  34.36 
 
 		 250 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03171  NADH dehydrogenase subunit B  38.62 
 
 		 244 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03161  NADH dehydrogenase subunit B  38.62 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575025  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1116  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  37.32 
 
 		 235 aa  121  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  39.74 
 
 		 235 aa  121  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1296  F420H2 dehydrogenase subunit B  40.3 
 
 		 184 aa  120  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1132  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  35.14 
 
 		 149 aa  120  9e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4708  NADH dehydrogenase subunit B  36.2 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146486  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1040  NADH dehydrogenase subunit B  38.62 
 
 		 250 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3413  NADH dehydrogenase subunit B  34.57 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1069  NADH dehydrogenase subunit B  38.62 
 
 		 250 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.523866 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  36.65 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3254  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  36.42 
 
 		 235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  39.71 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  35.06 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0705  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  36.88 
 
 		 232 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0621219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1918  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  36.88 
 
 		 229 aa  117  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1051  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  40.31 
 
 		 190 aa  117  7e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.188906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3526  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  36.24 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2273  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.34 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.732152  normal  0.19632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  44.53 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2012  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1079  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  37.76 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.231254  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4081  NADH dehydrogenase subunit B  36.13 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.343571  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1723  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  41.73 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  36.76 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.54 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2302  NADH dehydrogenase subunit B  40.15 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7018  NADH dehydrogenase subunit B  34.42 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  36.76 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  36.24 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  36.24 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  42.97 
 
 		 188 aa  114  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0593  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  35.17 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.75 
 
 		 291 aa  114  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0673  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  40.31 
 
 		 146 aa  114  8.999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4387  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.75 
 
 		 323 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  35.29 
 
 		 189 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  38.28 
 
 		 250 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1206  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  41.18 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000567314  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  36.55 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.97 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  37.41 
 
 		 176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1310  NADH dehydrogenase subunit B  41.73 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  37.14 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  36.18 
 
 		 268 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1791  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  40.31 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.102386  normal  0.996186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  35.53 
 
 		 268 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  31.18 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  37.24 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5099  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  39.13 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2588  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  39.55 
 
 		 145 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  40 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  41.73 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  42.97 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2983  NADH dehydrogenase subunit B  41.01 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  40.29 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13360  ech hydrogenase subunit C  37.04 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1288  NADH dehydrogenase subunit B  39.86 
 
 		 172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  36.24 
 
 		 181 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  36.99 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2455  ech hydrogenase subunit C  38.17 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0152532  normal  0.126862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1787  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  40 
 
 		 182 aa  111  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  38.03 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0705  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  34.44 
 
 		 231 aa  111  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2046  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  40.3 
 
 		 145 aa  111  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609806 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  37.86 
 
 		 169 aa  111  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  37.32 
 
 		 264 aa  111  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  37.86 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  37.86 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  36.71 
 
 		 167 aa  111  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  36.11 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  36.11 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  36.11 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  37.86 
 
 		 184 aa  110  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02800  conserved hypothetical protein  35.67 
 
 		 250 aa  110  9e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1070  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  34.04 
 
 		 142 aa  110  9e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1929  NADH dehydrogenase subunit B  39.29 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.659926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  41.67 
 
 		 792 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0150  ech hydrogenase subunit C  37.4 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  36.11 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>