More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2388 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 
225 aa  467  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  53.43 
 
 
268 aa  219  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  52.45 
 
 
268 aa  218  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 
190 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  61.59 
 
 
190 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  58.02 
 
 
189 aa  215  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  56.52 
 
 
190 aa  213  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.95 
 
 
176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  56.52 
 
 
189 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  63.27 
 
 
184 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  57.42 
 
 
189 aa  211  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 
264 aa  210  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  62.16 
 
 
173 aa  210  1e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  59.09 
 
 
189 aa  209  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  63.46 
 
 
170 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  53.16 
 
 
250 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  64.71 
 
 
170 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  58.18 
 
 
172 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.35 
 
 
251 aa  201  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 
172 aa  201  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 
179 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 
179 aa  201  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 
179 aa  201  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 
172 aa  201  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 
172 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 
172 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.14 
 
 
176 aa  201  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 
172 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  58.75 
 
 
172 aa  201  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  60.78 
 
 
172 aa  201  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.43 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  54.94 
 
 
184 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  47.72 
 
 
249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  47.72 
 
 
249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.5 
 
 
170 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.81 
 
 
170 aa  195  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
159 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
158 aa  193  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
158 aa  193  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
159 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1743  NADH dehydrogenase subunit B  56.29 
 
 
158 aa  193  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1617  NADH dehydrogenase subunit B  55.33 
 
 
161 aa  192  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
159 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0546  NADH dehydrogenase subunit B  55.33 
 
 
161 aa  192  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
159 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.29 
 
 
158 aa  193  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  54.6 
 
 
183 aa  192  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.29 
 
 
158 aa  192  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  54.97 
 
 
159 aa  192  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.82 
 
 
200 aa  191  5e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  52.15 
 
 
216 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
158 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  54.3 
 
 
159 aa  191  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.33 
 
 
170 aa  191  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  48.15 
 
 
246 aa  191  6e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.55 
 
 
191 aa  191  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  54.32 
 
 
173 aa  191  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  52.27 
 
 
228 aa  191  8e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1494  NADH dehydrogenase subunit B  54.97 
 
 
159 aa  191  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1828  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
173 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1436  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
173 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
173 aa  191  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.82 
 
 
200 aa  190  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  59.46 
 
 
170 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2165  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
159 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00589075  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
159 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
159 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.97 
 
 
159 aa  190  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
159 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
159 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5576  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
159 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000095063  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
158 aa  190  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  54.97 
 
 
158 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  56.29 
 
 
158 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  56.29 
 
 
158 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
159 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1029  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
159 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000403774  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2272  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
159 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000536448  normal  0.140602 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1636  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
159 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000193471  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
159 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
159 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  52.76 
 
 
182 aa  190  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.55 
 
 
200 aa  190  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  54.97 
 
 
158 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1123  NADH dehydrogenase subunit B  56.6 
 
 
168 aa  189  2e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  56.29 
 
 
160 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1344  NADH dehydrogenase subunit B  56.29 
 
 
159 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000452822  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  54.97 
 
 
158 aa  189  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  48.11 
 
 
244 aa  189  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  56.29 
 
 
160 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  55.33 
 
 
158 aa  189  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2008  NADH dehydrogenase subunit B  56.29 
 
 
159 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  57.82 
 
 
166 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.94 
 
 
169 aa  189  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  56.29 
 
 
160 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3213  NADH dehydrogenase subunit B  56.29 
 
 
159 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737859  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  58.5 
 
 
179 aa  189  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1425  NADH dehydrogenase subunit B  54.97 
 
 
159 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.301169  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  54.97 
 
 
160 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  56 
 
 
160 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>