More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1219 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1219  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
180 aa  379  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1739  NADH dehydrogenase subunit B  86.52 
 
 
181 aa  343  8.999999999999999e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210439  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1604  NADH dehydrogenase subunit B  82.02 
 
 
178 aa  329  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0888  NADH dehydrogenase subunit B  78.61 
 
 
195 aa  306  9e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.330095  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0377  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.15 
 
 
180 aa  238  5e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0166282  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2208  NADH dehydrogenase subunit B  52.69 
 
 
213 aa  193  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  40 
 
 
244 aa  130  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  41.38 
 
 
246 aa  130  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1859  NADH dehydrogenase subunit B  37.74 
 
 
245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25251  NADH dehydrogenase subunit B  37.89 
 
 
250 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03261  NADH dehydrogenase subunit B  46.09 
 
 
244 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  40.67 
 
 
235 aa  128  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1132  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  38.51 
 
 
149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  40.69 
 
 
249 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0295  NADH dehydrogenase subunit B  46.09 
 
 
244 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  39.73 
 
 
244 aa  128  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03161  NADH dehydrogenase subunit B  46.09 
 
 
244 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575025  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  40.69 
 
 
249 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03171  NADH dehydrogenase subunit B  46.09 
 
 
244 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3500  NADH dehydrogenase subunit B  40.26 
 
 
240 aa  128  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.693948 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1296  F420H2 dehydrogenase subunit B  42.54 
 
 
184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3413  NADH dehydrogenase subunit B  37.74 
 
 
238 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03191  NADH dehydrogenase subunit B  40.41 
 
 
252 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3411  F420H2 dehydrogenase subunit B  40.3 
 
 
184 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2045  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45 
 
 
196 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0111546  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3754  NADH dehydrogenase subunit B  41.61 
 
 
247 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651225 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1116  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  39.44 
 
 
235 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  40.76 
 
 
251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4708  NADH dehydrogenase subunit B  40.41 
 
 
259 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146486  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  40.82 
 
 
190 aa  125  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1040  NADH dehydrogenase subunit B  44.53 
 
 
250 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1069  NADH dehydrogenase subunit B  44.53 
 
 
250 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.523866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.34 
 
 
176 aa  124  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2012  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.29 
 
 
170 aa  123  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4081  NADH dehydrogenase subunit B  39.35 
 
 
180 aa  123  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.343571  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  43.41 
 
 
189 aa  123  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3254  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  40 
 
 
235 aa  123  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0705  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  39.01 
 
 
232 aa  123  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0621219  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1723  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.52 
 
 
170 aa  122  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  41.5 
 
 
268 aa  122  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1918  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  39.01 
 
 
229 aa  122  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  43.41 
 
 
190 aa  122  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  41.5 
 
 
268 aa  122  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  43.41 
 
 
190 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  42.64 
 
 
189 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  41.73 
 
 
176 aa  121  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  41.86 
 
 
189 aa  121  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0593  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  38.62 
 
 
164 aa  120  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  41.86 
 
 
189 aa  120  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2983  NADH dehydrogenase subunit B  42.28 
 
 
187 aa  120  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  46.62 
 
 
170 aa  120  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  40.97 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  41.43 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1051  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  41.86 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.188906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  40.28 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1288  NADH dehydrogenase subunit B  43.38 
 
 
172 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  40.28 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  40.28 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  40.28 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  40.28 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  40.28 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.88 
 
 
291 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7018  NADH dehydrogenase subunit B  36.18 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  40.28 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  40.28 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2302  NADH dehydrogenase subunit B  43.75 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  40.28 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  40.28 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  43.38 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  43.38 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  37.84 
 
 
250 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2273  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.53 
 
 
144 aa  119  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.732152  normal  0.19632 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  39.07 
 
 
185 aa  119  3e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  44.27 
 
 
184 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.41 
 
 
225 aa  118  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1310  NADH dehydrogenase subunit B  44.2 
 
 
177 aa  119  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686478  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  41.18 
 
 
184 aa  119  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  44.27 
 
 
184 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.03 
 
 
188 aa  118  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  46.15 
 
 
173 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  43.07 
 
 
184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1084  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  38.13 
 
 
154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00491903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.54 
 
 
169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3526  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  39.16 
 
 
144 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  40.44 
 
 
183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2572  NADH dehydrogenase subunit B  44.19 
 
 
173 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  39.13 
 
 
185 aa  117  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.86 
 
 
169 aa  117  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  41.61 
 
 
794 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1377  NADH dehydrogenase subunit B  44.19 
 
 
173 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.820361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1276  NADH dehydrogenase subunit B  44.19 
 
 
173 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5099  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  40.58 
 
 
181 aa  117  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4387  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.31 
 
 
323 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0330  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  41.86 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2588  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  42.11 
 
 
145 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  38.41 
 
 
179 aa  117  9.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  38.26 
 
 
181 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0705  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  38.81 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2046  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.96 
 
 
145 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  40.52 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>