More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2472 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 
176 aa  364  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  78.92 
 
 
184 aa  284  4e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  80 
 
 
176 aa  276  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  79.47 
 
 
173 aa  268  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  69.23 
 
 
190 aa  267  5.9999999999999995e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  79.87 
 
 
190 aa  266  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  80.14 
 
 
189 aa  265  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  79.45 
 
 
189 aa  263  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  79.45 
 
 
189 aa  263  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  78.38 
 
 
190 aa  261  4.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  81.12 
 
 
189 aa  258  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.95 
 
 
225 aa  213  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  67.59 
 
 
174 aa  206  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.52 
 
 
158 aa  204  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  66.21 
 
 
176 aa  204  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  66.21 
 
 
174 aa  204  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.21 
 
 
158 aa  204  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  65.52 
 
 
177 aa  203  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  65.52 
 
 
177 aa  202  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  65.52 
 
 
174 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2165  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
159 aa  201  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00589075  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.51 
 
 
191 aa  201  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5576  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
159 aa  201  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000095063  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  65.03 
 
 
158 aa  201  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1029  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
159 aa  201  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000403774  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
159 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
159 aa  201  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1636  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
159 aa  201  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000193471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2272  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
159 aa  201  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000536448  normal  0.140602 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
159 aa  201  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
159 aa  201  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
159 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
159 aa  201  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
159 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.14 
 
 
159 aa  201  6e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  64.83 
 
 
175 aa  200  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1828  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
173 aa  200  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1436  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
173 aa  200  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
173 aa  200  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  64.34 
 
 
186 aa  200  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  63.45 
 
 
158 aa  200  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  65.03 
 
 
160 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  66.21 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  66.21 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  67.61 
 
 
170 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  65.03 
 
 
160 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2008  NADH dehydrogenase subunit B  65.03 
 
 
159 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3213  NADH dehydrogenase subunit B  65.03 
 
 
159 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737859  normal 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  59.74 
 
 
166 aa  200  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1344  NADH dehydrogenase subunit B  65.03 
 
 
159 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000452822  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
158 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  65.03 
 
 
160 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  64.34 
 
 
160 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
158 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.62 
 
 
167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  62.94 
 
 
158 aa  198  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  59.35 
 
 
167 aa  198  3e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
158 aa  198  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1310  NADH dehydrogenase subunit B  62.84 
 
 
177 aa  198  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686478  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
158 aa  198  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0928  NADH dehydrogenase subunit B  63.64 
 
 
160 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0103047  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  64.08 
 
 
160 aa  197  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4632  NADH dehydrogenase subunit B  63.76 
 
 
194 aa  197  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.625417  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  64.08 
 
 
160 aa  197  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1556  NADH dehydrogenase subunit B  62.76 
 
 
185 aa  197  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  63.64 
 
 
158 aa  197  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
172 aa  197  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
179 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
179 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
179 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2919  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.44 
 
 
187 aa  197  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4391  NADH dehydrogenase subunit B  61.44 
 
 
195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4127  NADH dehydrogenase subunit B  61.44 
 
 
197 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  62.24 
 
 
159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  63.27 
 
 
185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  59.74 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2983  NADH dehydrogenase subunit B  62 
 
 
187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  64.34 
 
 
191 aa  196  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  65.73 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  66.43 
 
 
170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1143  NADH dehydrogenase subunit B  62.76 
 
 
158 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0196074  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 
179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1023  NADH dehydrogenase subunit B  64.83 
 
 
190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1356  NADH dehydrogenase subunit B  63.01 
 
 
188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118865  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2423  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 
193 aa  195  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1764  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.94 
 
 
158 aa  195  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0950  NADH dehydrogenase subunit B  62.94 
 
 
158 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0972476  normal  0.726219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1260  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 
194 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2302  NADH dehydrogenase subunit B  59.21 
 
 
181 aa  194  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  60.53 
 
 
228 aa  194  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_002978  WD1123  NADH dehydrogenase subunit B  63.27 
 
 
168 aa  194  5.000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1018  NADH dehydrogenase subunit B  60.78 
 
 
195 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2398  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.78 
 
 
180 aa  194  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1352  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 
194 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935175  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>