More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0510 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  100 
 
 
184 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  78.92 
 
 
176 aa  284  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  74.84 
 
 
173 aa  269  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  77.27 
 
 
176 aa  268  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  72.39 
 
 
190 aa  263  8e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  74.05 
 
 
190 aa  263  8.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  71.78 
 
 
189 aa  262  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  67.23 
 
 
189 aa  261  4.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  70.55 
 
 
189 aa  260  8.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  69.94 
 
 
189 aa  259  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  70.55 
 
 
190 aa  257  7e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.27 
 
 
225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  58.82 
 
 
185 aa  206  1e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  61.78 
 
 
177 aa  206  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  62.09 
 
 
177 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.09 
 
 
158 aa  206  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 
191 aa  205  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 
175 aa  204  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  63.16 
 
 
174 aa  204  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  65.52 
 
 
167 aa  204  5e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  63.51 
 
 
186 aa  204  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  63.16 
 
 
176 aa  204  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  61.78 
 
 
174 aa  204  6e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1356  NADH dehydrogenase subunit B  60.25 
 
 
188 aa  204  6e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118865  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  62.5 
 
 
160 aa  204  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  62.5 
 
 
160 aa  204  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  62.91 
 
 
158 aa  203  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.59 
 
 
158 aa  203  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  62.5 
 
 
160 aa  203  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  62.5 
 
 
174 aa  203  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  62.5 
 
 
160 aa  203  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 
158 aa  203  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  58.38 
 
 
179 aa  203  1e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 
158 aa  202  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  61.07 
 
 
158 aa  202  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
158 aa  202  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2572  NADH dehydrogenase subunit B  66.2 
 
 
173 aa  202  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 
158 aa  202  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1260  NADH dehydrogenase subunit B  58.75 
 
 
194 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  61.07 
 
 
158 aa  202  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  61.84 
 
 
160 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  63.51 
 
 
191 aa  202  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.59 
 
 
159 aa  201  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 
158 aa  201  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1352  NADH dehydrogenase subunit B  58.75 
 
 
194 aa  201  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935175  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1377  NADH dehydrogenase subunit B  63.82 
 
 
173 aa  201  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.820361  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
159 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
159 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1276  NADH dehydrogenase subunit B  63.82 
 
 
173 aa  201  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2919  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.75 
 
 
187 aa  201  6e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
159 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
159 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
159 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1887  NADH dehydrogenase subunit B  61.84 
 
 
207 aa  201  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1029  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
159 aa  200  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000403774  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1828  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
173 aa  200  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  61.18 
 
 
160 aa  200  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1436  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
173 aa  200  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5576  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
159 aa  200  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000095063  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1743  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 
158 aa  200  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2165  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
159 aa  200  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00589075  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2272  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
159 aa  200  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000536448  normal  0.140602 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
173 aa  200  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1636  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
159 aa  200  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000193471  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1023  NADH dehydrogenase subunit B  59.75 
 
 
190 aa  200  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
159 aa  200  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
159 aa  200  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0928  NADH dehydrogenase subunit B  61.18 
 
 
160 aa  200  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0103047  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0950  NADH dehydrogenase subunit B  62.25 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0972476  normal  0.726219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2220  NADH dehydrogenase subunit B  60.53 
 
 
202 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0889  NADH dehydrogenase subunit B  58.13 
 
 
192 aa  199  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1344  NADH dehydrogenase subunit B  61.07 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000452822  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  59.73 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1143  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
158 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0196074  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2008  NADH dehydrogenase subunit B  61.07 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3213  NADH dehydrogenase subunit B  61.07 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737859  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0779  NADH dehydrogenase subunit B  59.12 
 
 
193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.348206  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1123  NADH dehydrogenase subunit B  57.58 
 
 
168 aa  199  3e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  62.58 
 
 
172 aa  198  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  62.58 
 
 
179 aa  198  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  62.58 
 
 
179 aa  198  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  62.58 
 
 
179 aa  198  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2398  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 
180 aa  198  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4562  NADH dehydrogenase subunit B  59.12 
 
 
194 aa  198  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  61.94 
 
 
172 aa  198  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  62.58 
 
 
172 aa  198  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  62.58 
 
 
172 aa  198  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  62.58 
 
 
172 aa  198  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  62.58 
 
 
172 aa  198  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4391  NADH dehydrogenase subunit B  59.75 
 
 
195 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  62.58 
 
 
172 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1084  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
195 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0355895 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2423  NADH dehydrogenase subunit B  57.5 
 
 
193 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4127  NADH dehydrogenase subunit B  59.75 
 
 
197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1213  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
195 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1310  NADH dehydrogenase subunit B  57.67 
 
 
177 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686478  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  62.58 
 
 
172 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2060  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
158 aa  197  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1764  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.74 
 
 
158 aa  197  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381337  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  59.06 
 
 
158 aa  197  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>