More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0845 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  93.65 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  92.59 
 
 		 190 aa  370  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  92.59 
 
 		 189 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  90.27 
 
 		 190 aa  357  7e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  88.89 
 
 		 190 aa  356  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  86.77 
 
 		 189 aa  346  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  80.14 
 
 		 176 aa  265  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  71.78 
 
 		 184 aa  262  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  73.29 
 
 		 176 aa  245  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  71.13 
 
 		 173 aa  238  5e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.02 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.97 
 
 		 251 aa  204  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  60.65 
 
 		 268 aa  201  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  60.51 
 
 		 264 aa  200  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  60.54 
 
 		 170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  60.54 
 
 		 172 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2572  NADH dehydrogenase subunit B  60.65 
 
 		 173 aa  198  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1859  NADH dehydrogenase subunit B  52 
 
 		 245 aa  197  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 268 aa  197  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.81 
 
 		 158 aa  197  7.999999999999999e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 		 158 aa  197  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 		 158 aa  197  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1276  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1377  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.820361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1288  NADH dehydrogenase subunit B  59.51 
 
 		 172 aa  195  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 		 170 aa  195  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  58.94 
 
 		 158 aa  195  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 		 188 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  58.04 
 
 		 244 aa  195  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  58.78 
 
 		 159 aa  194  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.76 
 
 		 202 aa  194  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  59.46 
 
 		 158 aa  194  6e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.78 
 
 		 158 aa  193  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  58.28 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03171  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 		 244 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03161  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 		 244 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575025  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1040  NADH dehydrogenase subunit B  54.05 
 
 		 250 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  54.61 
 
 		 246 aa  192  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03261  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.33 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1069  NADH dehydrogenase subunit B  54.05 
 
 		 250 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.523866 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.05 
 
 		 170 aa  192  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  64.75 
 
 		 170 aa  192  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0295  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.82 
 
 		 170 aa  192  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  57.52 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3754  NADH dehydrogenase subunit B  54.05 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651225 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25251  NADH dehydrogenase subunit B  54.36 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  58.5 
 
 		 160 aa  192  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  58.5 
 
 		 160 aa  192  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  50.29 
 
 		 249 aa  191  5e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  50.29 
 
 		 249 aa  191  5e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  56.69 
 
 		 169 aa  191  6e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  54.36 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  54.05 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.14 
 
 		 170 aa  191  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1425  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 159 aa  191  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.301169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 158 aa  191  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 		 191 aa  191  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 159 aa  190  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2272  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 159 aa  190  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000536448  normal  0.140602 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 159 aa  190  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 159 aa  190  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5576  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 159 aa  190  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000095063  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 159 aa  190  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  64.29 
 
 		 173 aa  190  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1029  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 159 aa  190  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000403774  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1636  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 159 aa  190  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000193471  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2165  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 159 aa  190  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00589075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 159 aa  190  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 159 aa  190  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 159 aa  190  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 		 169 aa  190  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1828  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 173 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1436  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 173 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 173 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  57.82 
 
 		 170 aa  189  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 160 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.76 
 
 		 159 aa  189  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1344  NADH dehydrogenase subunit B  56.76 
 
 		 159 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000452822  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  57.93 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.31 
 
 		 291 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  58.11 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 		 160 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2008  NADH dehydrogenase subunit B  56.76 
 
 		 159 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.49233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>