More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1023 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1023  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 190 aa  394  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0803  NADH dehydrogenase subunit B  88.89 
 
 		 193 aa  355  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2423  NADH dehydrogenase subunit B  87.56 
 
 		 193 aa  355  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0798  NADH dehydrogenase subunit B  88.89 
 
 		 193 aa  355  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.802177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0889  NADH dehydrogenase subunit B  88.65 
 
 		 192 aa  351  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1352  NADH dehydrogenase subunit B  87.7 
 
 		 194 aa  349  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1260  NADH dehydrogenase subunit B  86.63 
 
 		 194 aa  347  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0779  NADH dehydrogenase subunit B  84.97 
 
 		 193 aa  343  8.999999999999999e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.348206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2573  NADH dehydrogenase subunit B  87.5 
 
 		 204 aa  341  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196668  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2886  NADH dehydrogenase subunit B  86.96 
 
 		 199 aa  341  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.102099 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3299  NADH dehydrogenase subunit B  86.96 
 
 		 198 aa  339  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1713  NADH dehydrogenase subunit B  85.11 
 
 		 195 aa  338  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4127  NADH dehydrogenase subunit B  86.34 
 
 		 197 aa  338  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2059  NADH dehydrogenase subunit B  84.7 
 
 		 195 aa  336  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.769624  normal  0.464052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4562  NADH dehydrogenase subunit B  84.78 
 
 		 194 aa  336  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4391  NADH dehydrogenase subunit B  85.25 
 
 		 195 aa  336  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2400  NADH dehydrogenase subunit B  85.33 
 
 		 201 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4632  NADH dehydrogenase subunit B  81.44 
 
 		 194 aa  335  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.625417  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2220  NADH dehydrogenase subunit B  85.25 
 
 		 202 aa  334  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1084  NADH dehydrogenase subunit B  84.7 
 
 		 195 aa  332  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0355895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1018  NADH dehydrogenase subunit B  84.7 
 
 		 195 aa  332  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1213  NADH dehydrogenase subunit B  84.7 
 
 		 195 aa  332  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1887  NADH dehydrogenase subunit B  80 
 
 		 207 aa  331  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2919  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  84.07 
 
 		 187 aa  326  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.14 
 
 		 191 aa  315  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  93.67 
 
 		 177 aa  311  3.9999999999999997e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2398  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  85.06 
 
 		 180 aa  310  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5810  NADH dehydrogenase subunit B  88.96 
 
 		 185 aa  308  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  90.51 
 
 		 174 aa  305  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  90.51 
 
 		 176 aa  305  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  90.51 
 
 		 174 aa  305  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  91.08 
 
 		 177 aa  305  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1356  NADH dehydrogenase subunit B  85.37 
 
 		 188 aa  304  5.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118865  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  84.39 
 
 		 174 aa  303  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2302  NADH dehydrogenase subunit B  76.7 
 
 		 181 aa  296  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  82.94 
 
 		 175 aa  295  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2983  NADH dehydrogenase subunit B  79.89 
 
 		 187 aa  291  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1310  NADH dehydrogenase subunit B  81.71 
 
 		 177 aa  288  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2835  NADH dehydrogenase subunit B  83.54 
 
 		 196 aa  277  7e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0973077  normal  0.124662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  76.92 
 
 		 186 aa  270  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  76.83 
 
 		 191 aa  266  8.999999999999999e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  80.65 
 
 		 158 aa  261  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  80.65 
 
 		 158 aa  260  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1556  NADH dehydrogenase subunit B  65.79 
 
 		 185 aa  259  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  80 
 
 		 159 aa  259  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  78.06 
 
 		 158 aa  257  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  78.06 
 
 		 158 aa  257  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  76.77 
 
 		 158 aa  255  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  76.77 
 
 		 158 aa  255  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  78.06 
 
 		 158 aa  254  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  74.19 
 
 		 167 aa  254  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  77.42 
 
 		 160 aa  254  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  77.42 
 
 		 160 aa  254  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  77.42 
 
 		 160 aa  254  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  78.71 
 
 		 158 aa  253  9e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  79.08 
 
 		 158 aa  253  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  79.08 
 
 		 158 aa  253  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  76.77 
 
 		 160 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1764  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  78.71 
 
 		 158 aa  253  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1344  NADH dehydrogenase subunit B  76.77 
 
 		 159 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000452822  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2008  NADH dehydrogenase subunit B  76.77 
 
 		 159 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3213  NADH dehydrogenase subunit B  76.77 
 
 		 159 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0928  NADH dehydrogenase subunit B  76.77 
 
 		 160 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0103047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  75.48 
 
 		 159 aa  252  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0950  NADH dehydrogenase subunit B  77.42 
 
 		 158 aa  252  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0972476  normal  0.726219 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2830  NADH dehydrogenase subunit B  76.28 
 
 		 184 aa  252  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 159 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 159 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01288  NADH dehydrogenase subunit B  78.43 
 
 		 182 aa  251  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  73.53 
 
 		 185 aa  251  5.000000000000001e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2165  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 159 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00589075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 159 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5576  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 159 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000095063  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 159 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1029  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 159 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000403774  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 159 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1636  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 159 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000193471  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 159 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 159 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2272  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 159 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000536448  normal  0.140602 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1828  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 173 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1436  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 173 aa  251  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 173 aa  251  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  77.42 
 
 		 158 aa  250  7e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3255  NADH dehydrogenase subunit B  75.48 
 
 		 159 aa  250  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.551584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1743  NADH dehydrogenase subunit B  76.77 
 
 		 158 aa  249  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  79.47 
 
 		 158 aa  250  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  73.94 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2060  NADH dehydrogenase subunit B  76.77 
 
 		 158 aa  249  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1425  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 159 aa  250  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.301169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0270  NADH dehydrogenase subunit B  78.81 
 
 		 184 aa  248  3e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1143  NADH dehydrogenase subunit B  76.77 
 
 		 158 aa  248  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0196074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0241  NADH dehydrogenase subunit B  78.81 
 
 		 184 aa  248  3e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3598  putative NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.94 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 158 aa  248  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  76.28 
 
 		 159 aa  248  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 158 aa  248  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  76.28 
 
 		 159 aa  248  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 160 aa  248  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  76.28 
 
 		 159 aa  248  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>