More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1175 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 176 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 174 aa  364  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  97.7 
 
 		 174 aa  356  9e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  91.95 
 
 		 175 aa  341  4e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  91.33 
 
 		 177 aa  338  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  89.66 
 
 		 174 aa  337  5.9999999999999996e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  91.67 
 
 		 177 aa  332  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1023  NADH dehydrogenase subunit B  90.51 
 
 		 190 aa  305  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1260  NADH dehydrogenase subunit B  89.24 
 
 		 194 aa  303  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1352  NADH dehydrogenase subunit B  89.24 
 
 		 194 aa  303  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2423  NADH dehydrogenase subunit B  86.23 
 
 		 193 aa  303  9.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4127  NADH dehydrogenase subunit B  83.24 
 
 		 197 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4391  NADH dehydrogenase subunit B  83.24 
 
 		 195 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2919  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  89.87 
 
 		 187 aa  301  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0803  NADH dehydrogenase subunit B  86.23 
 
 		 193 aa  301  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0798  NADH dehydrogenase subunit B  86.23 
 
 		 193 aa  301  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.802177  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  91.56 
 
 		 191 aa  301  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4632  NADH dehydrogenase subunit B  84.43 
 
 		 194 aa  300  8.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.625417  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2220  NADH dehydrogenase subunit B  88.54 
 
 		 202 aa  300  8.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0889  NADH dehydrogenase subunit B  87.97 
 
 		 192 aa  300  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2059  NADH dehydrogenase subunit B  88.61 
 
 		 195 aa  298  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.769624  normal  0.464052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2573  NADH dehydrogenase subunit B  88.54 
 
 		 204 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196668  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2886  NADH dehydrogenase subunit B  87.9 
 
 		 199 aa  298  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.102099 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3299  NADH dehydrogenase subunit B  87.34 
 
 		 198 aa  298  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1887  NADH dehydrogenase subunit B  88.54 
 
 		 207 aa  297  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2398  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  87.97 
 
 		 180 aa  297  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2302  NADH dehydrogenase subunit B  86.08 
 
 		 181 aa  296  9e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4562  NADH dehydrogenase subunit B  87.34 
 
 		 194 aa  296  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2400  NADH dehydrogenase subunit B  80.92 
 
 		 201 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1018  NADH dehydrogenase subunit B  86.71 
 
 		 195 aa  295  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1084  NADH dehydrogenase subunit B  86.71 
 
 		 195 aa  295  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0355895 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1213  NADH dehydrogenase subunit B  86.71 
 
 		 195 aa  295  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5810  NADH dehydrogenase subunit B  87.26 
 
 		 185 aa  294  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0779  NADH dehydrogenase subunit B  84.66 
 
 		 193 aa  294  4e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.348206  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1310  NADH dehydrogenase subunit B  87.26 
 
 		 177 aa  293  7e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1356  NADH dehydrogenase subunit B  85.99 
 
 		 188 aa  291  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118865  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2983  NADH dehydrogenase subunit B  82.42 
 
 		 187 aa  291  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1713  NADH dehydrogenase subunit B  86.16 
 
 		 195 aa  289  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  76.65 
 
 		 186 aa  275  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  74.25 
 
 		 191 aa  272  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2835  NADH dehydrogenase subunit B  85.35 
 
 		 196 aa  268  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0973077  normal  0.124662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1556  NADH dehydrogenase subunit B  74.25 
 
 		 185 aa  267  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  82.12 
 
 		 158 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  83.44 
 
 		 158 aa  264  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  82.78 
 
 		 159 aa  263  7e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  79.08 
 
 		 158 aa  262  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  79.08 
 
 		 158 aa  262  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  82.43 
 
 		 158 aa  260  6e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  82.43 
 
 		 158 aa  260  6e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  81.46 
 
 		 160 aa  260  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  81.46 
 
 		 160 aa  260  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  81.46 
 
 		 160 aa  260  8.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  80.79 
 
 		 160 aa  259  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  74.52 
 
 		 167 aa  259  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2008  NADH dehydrogenase subunit B  81.33 
 
 		 159 aa  258  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1344  NADH dehydrogenase subunit B  81.33 
 
 		 159 aa  258  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000452822  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  77.78 
 
 		 159 aa  258  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3213  NADH dehydrogenase subunit B  81.33 
 
 		 159 aa  258  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0928  NADH dehydrogenase subunit B  80.79 
 
 		 160 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0103047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0950  NADH dehydrogenase subunit B  81.46 
 
 		 158 aa  258  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0972476  normal  0.726219 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  77.12 
 
 		 158 aa  258  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  77.12 
 
 		 158 aa  258  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2272  NADH dehydrogenase subunit B  80.67 
 
 		 159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000536448  normal  0.140602 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  80.67 
 
 		 159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  80.67 
 
 		 159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  80.67 
 
 		 159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1029  NADH dehydrogenase subunit B  80.67 
 
 		 159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000403774  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  80.67 
 
 		 159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5576  NADH dehydrogenase subunit B  80.67 
 
 		 159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000095063  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  80.67 
 
 		 159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2165  NADH dehydrogenase subunit B  80.67 
 
 		 159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00589075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1636  NADH dehydrogenase subunit B  80.67 
 
 		 159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000193471  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  80.67 
 
 		 159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  80.67 
 
 		 159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  80.67 
 
 		 158 aa  257  6e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  77.78 
 
 		 158 aa  257  6e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1828  NADH dehydrogenase subunit B  80.13 
 
 		 173 aa  257  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1436  NADH dehydrogenase subunit B  80.13 
 
 		 173 aa  257  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  81.46 
 
 		 158 aa  257  7e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  80.13 
 
 		 173 aa  257  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1764  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.74 
 
 		 158 aa  256  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381337  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  80.67 
 
 		 160 aa  255  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  80.67 
 
 		 160 aa  255  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  78.43 
 
 		 158 aa  255  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2060  NADH dehydrogenase subunit B  79.47 
 
 		 158 aa  255  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2830  NADH dehydrogenase subunit B  76.28 
 
 		 184 aa  255  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1425  NADH dehydrogenase subunit B  78.67 
 
 		 159 aa  254  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.301169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01288  NADH dehydrogenase subunit B  78.43 
 
 		 182 aa  254  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3255  NADH dehydrogenase subunit B  77.48 
 
 		 159 aa  253  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.551584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  78.67 
 
 		 158 aa  253  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  78.67 
 
 		 158 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1743  NADH dehydrogenase subunit B  79.33 
 
 		 158 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  77.27 
 
 		 159 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  77.27 
 
 		 159 aa  252  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  81.56 
 
 		 166 aa  252  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1143  NADH dehydrogenase subunit B  78.15 
 
 		 158 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0196074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  77.27 
 
 		 159 aa  252  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  77.22 
 
 		 185 aa  251  3e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  77.44 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  76.62 
 
 		 159 aa  251  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>