More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2272 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5576  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 159 aa  331  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000095063  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1029  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 159 aa  331  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000403774  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1636  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 159 aa  331  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000193471  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2165  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 159 aa  331  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00589075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 159 aa  331  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 159 aa  331  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2272  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 159 aa  331  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000536448  normal  0.140602 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2008  NADH dehydrogenase subunit B  99.37 
 
 		 159 aa  330  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1344  NADH dehydrogenase subunit B  99.37 
 
 		 159 aa  330  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000452822  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3213  NADH dehydrogenase subunit B  99.37 
 
 		 159 aa  330  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  99.37 
 
 		 159 aa  329  8e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  99.37 
 
 		 159 aa  329  8e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  99.37 
 
 		 159 aa  329  8e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  99.37 
 
 		 159 aa  329  8e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  99.37 
 
 		 159 aa  329  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1828  NADH dehydrogenase subunit B  99.37 
 
 		 173 aa  328  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1436  NADH dehydrogenase subunit B  99.37 
 
 		 173 aa  328  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  99.37 
 
 		 173 aa  328  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  95.6 
 
 		 160 aa  324  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  95.6 
 
 		 160 aa  324  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  95.6 
 
 		 160 aa  324  4.0000000000000003e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  94.97 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0928  NADH dehydrogenase subunit B  93.71 
 
 		 160 aa  321  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0103047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  91.14 
 
 		 158 aa  314  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  91.82 
 
 		 159 aa  312  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  91.77 
 
 		 158 aa  311  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0950  NADH dehydrogenase subunit B  91.77 
 
 		 158 aa  310  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0972476  normal  0.726219 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  89.94 
 
 		 160 aa  310  4.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  89.94 
 
 		 160 aa  310  4.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  91.14 
 
 		 158 aa  310  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1143  NADH dehydrogenase subunit B  89.87 
 
 		 158 aa  308  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0196074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  91.14 
 
 		 158 aa  309  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  88.61 
 
 		 158 aa  308  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2060  NADH dehydrogenase subunit B  91.14 
 
 		 158 aa  308  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1743  NADH dehydrogenase subunit B  89.24 
 
 		 158 aa  307  5e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  89.24 
 
 		 159 aa  307  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1425  NADH dehydrogenase subunit B  88.61 
 
 		 159 aa  306  6.999999999999999e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.301169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  88.61 
 
 		 158 aa  301  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3255  NADH dehydrogenase subunit B  86.08 
 
 		 159 aa  302  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.551584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  86.71 
 
 		 158 aa  301  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  86.08 
 
 		 158 aa  300  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  86.08 
 
 		 158 aa  300  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  87.34 
 
 		 158 aa  300  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  86.71 
 
 		 158 aa  300  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  86.71 
 
 		 158 aa  300  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1764  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  84.81 
 
 		 158 aa  295  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381337  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  87.26 
 
 		 159 aa  294  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  87.26 
 
 		 159 aa  294  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  85.99 
 
 		 159 aa  292  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  85.35 
 
 		 159 aa  290  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  82.17 
 
 		 159 aa  285  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2830  NADH dehydrogenase subunit B  85.62 
 
 		 184 aa  284  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01288  NADH dehydrogenase subunit B  84.31 
 
 		 182 aa  282  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  82.05 
 
 		 158 aa  282  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  82.05 
 
 		 158 aa  282  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0241  NADH dehydrogenase subunit B  84.87 
 
 		 184 aa  281  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0270  NADH dehydrogenase subunit B  84.87 
 
 		 184 aa  281  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1494  NADH dehydrogenase subunit B  82.8 
 
 		 159 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1556  NADH dehydrogenase subunit B  80.39 
 
 		 185 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  82.35 
 
 		 191 aa  271  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  82.12 
 
 		 186 aa  268  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  77.22 
 
 		 167 aa  266  8e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1617  NADH dehydrogenase subunit B  80.39 
 
 		 161 aa  266  1e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025993  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0546  NADH dehydrogenase subunit B  80.39 
 
 		 161 aa  266  1e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  78.43 
 
 		 167 aa  262  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02800  conserved hypothetical protein  80.41 
 
 		 250 aa  261  3e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  81.56 
 
 		 166 aa  258  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1310  NADH dehydrogenase subunit B  79.08 
 
 		 177 aa  258  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  80.67 
 
 		 176 aa  257  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2983  NADH dehydrogenase subunit B  77.78 
 
 		 187 aa  257  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  80.67 
 
 		 174 aa  257  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  79.33 
 
 		 177 aa  256  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  78.52 
 
 		 228 aa  254  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  79.47 
 
 		 174 aa  255  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2302  NADH dehydrogenase subunit B  76.47 
 
 		 181 aa  255  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  77.63 
 
 		 179 aa  254  4e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  78.67 
 
 		 174 aa  254  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2423  NADH dehydrogenase subunit B  78.67 
 
 		 193 aa  253  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  76.43 
 
 		 191 aa  253  8e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_002978  WD1123  NADH dehydrogenase subunit B  78 
 
 		 168 aa  253  8e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0803  NADH dehydrogenase subunit B  78.67 
 
 		 193 aa  252  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0798  NADH dehydrogenase subunit B  78.67 
 
 		 193 aa  252  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.802177  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  78 
 
 		 177 aa  252  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1260  NADH dehydrogenase subunit B  78.67 
 
 		 194 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  77.18 
 
 		 185 aa  251  2.0000000000000002e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1352  NADH dehydrogenase subunit B  78.67 
 
 		 194 aa  251  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1023  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 190 aa  251  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2919  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  76.1 
 
 		 187 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1356  NADH dehydrogenase subunit B  76.13 
 
 		 188 aa  250  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118865  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2059  NADH dehydrogenase subunit B  76.73 
 
 		 195 aa  249  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.769624  normal  0.464052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4391  NADH dehydrogenase subunit B  76.1 
 
 		 195 aa  248  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1018  NADH dehydrogenase subunit B  76.1 
 
 		 195 aa  248  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4127  NADH dehydrogenase subunit B  76.1 
 
 		 197 aa  248  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0889  NADH dehydrogenase subunit B  78 
 
 		 192 aa  248  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5810  NADH dehydrogenase subunit B  76.67 
 
 		 185 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  76.67 
 
 		 175 aa  248  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2398  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  76.1 
 
 		 180 aa  248  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3570  putative NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  75.5 
 
 		 297 aa  248  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0658  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  75.5 
 
 		 293 aa  248  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3598  putative NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  75.5 
 
 		 262 aa  248  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>