More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0744 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
189 aa  388  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  87.83 
 
 
189 aa  350  5e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  87.3 
 
 
189 aa  347  7e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  86.77 
 
 
189 aa  346  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  85.19 
 
 
190 aa  342  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  86.24 
 
 
190 aa  338  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  86.56 
 
 
190 aa  338  2.9999999999999998e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  67.23 
 
 
184 aa  261  4.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  81.12 
 
 
176 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  73.29 
 
 
176 aa  241  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  71.13 
 
 
173 aa  234  6e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.09 
 
 
225 aa  209  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.03 
 
 
251 aa  202  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  61.15 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.93 
 
 
188 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 
172 aa  194  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.94 
 
 
183 aa  194  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.13 
 
 
158 aa  194  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1276  NADH dehydrogenase subunit B  57.23 
 
 
173 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.89 
 
 
291 aa  194  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1377  NADH dehydrogenase subunit B  57.23 
 
 
173 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.820361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 
172 aa  193  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 
179 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 
179 aa  193  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 
179 aa  193  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 
172 aa  193  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 
172 aa  193  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 
172 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 
172 aa  193  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2572  NADH dehydrogenase subunit B  57.23 
 
 
173 aa  193  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 
172 aa  193  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 
172 aa  193  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
170 aa  193  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.4 
 
 
188 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  63.19 
 
 
170 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  58.71 
 
 
268 aa  192  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1288  NADH dehydrogenase subunit B  58.28 
 
 
172 aa  191  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  58.17 
 
 
158 aa  191  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  58.17 
 
 
158 aa  191  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  58.33 
 
 
268 aa  191  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.18 
 
 
170 aa  191  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1859  NADH dehydrogenase subunit B  51.74 
 
 
245 aa  191  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.98 
 
 
202 aa  191  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  59.01 
 
 
173 aa  191  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  57.52 
 
 
158 aa  190  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  57.52 
 
 
158 aa  190  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  50.87 
 
 
244 aa  190  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1543  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.63 
 
 
175 aa  190  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 
159 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 
185 aa  189  2e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  58.5 
 
 
170 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4387  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.81 
 
 
323 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  57.24 
 
 
167 aa  189  2.9999999999999997e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  56.69 
 
 
250 aa  188  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
158 aa  188  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.52 
 
 
158 aa  188  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  57.62 
 
 
174 aa  187  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1069  NADH dehydrogenase subunit B  53.38 
 
 
250 aa  187  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.523866 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  58.11 
 
 
166 aa  187  7e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1040  NADH dehydrogenase subunit B  53.38 
 
 
250 aa  187  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  57.14 
 
 
170 aa  187  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.46 
 
 
170 aa  187  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  59.33 
 
 
188 aa  187  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 
177 aa  186  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1743  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 
158 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  52.6 
 
 
246 aa  187  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 
158 aa  187  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3754  NADH dehydrogenase subunit B  49.38 
 
 
247 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651225 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03261  NADH dehydrogenase subunit B  52.9 
 
 
244 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  57.24 
 
 
160 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  56.86 
 
 
160 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  56.86 
 
 
160 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  57.24 
 
 
160 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03161  NADH dehydrogenase subunit B  54.05 
 
 
244 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575025  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  58.87 
 
 
186 aa  186  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0295  NADH dehydrogenase subunit B  54.05 
 
 
244 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5810  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 
185 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 
177 aa  186  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.78 
 
 
170 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  56.86 
 
 
160 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03171  NADH dehydrogenase subunit B  54.05 
 
 
244 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
158 aa  186  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 
175 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 
179 aa  185  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1123  NADH dehydrogenase subunit B  58.45 
 
 
168 aa  185  3e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  56.21 
 
 
158 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  56.58 
 
 
174 aa  185  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  53.38 
 
 
235 aa  185  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25251  NADH dehydrogenase subunit B  53.02 
 
 
250 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.62 
 
 
169 aa  185  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  54.73 
 
 
179 aa  185  3e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03191  NADH dehydrogenase subunit B  51.27 
 
 
252 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  56.58 
 
 
176 aa  185  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  56.46 
 
 
170 aa  185  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3255  NADH dehydrogenase subunit B  55.56 
 
 
159 aa  184  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.551584  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2423  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
193 aa  184  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  56.21 
 
 
159 aa  184  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  52.35 
 
 
249 aa  184  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  52.35 
 
 
249 aa  184  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  56.21 
 
 
159 aa  184  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>