More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1377 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1377  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.820361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1276  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2572  NADH dehydrogenase subunit B  98.84 
 
 
173 aa  352  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1288  NADH dehydrogenase subunit B  89.29 
 
 
172 aa  310  9e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  63.82 
 
 
184 aa  201  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 
190 aa  196  9e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 
190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  56.02 
 
 
189 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  57.23 
 
 
189 aa  194  6e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.06 
 
 
176 aa  194  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  58.71 
 
 
190 aa  193  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.12 
 
 
176 aa  192  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  64.03 
 
 
173 aa  190  9e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  61.97 
 
 
174 aa  187  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  61.97 
 
 
176 aa  187  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.59 
 
 
191 aa  187  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  61.59 
 
 
174 aa  187  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
177 aa  186  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  61.27 
 
 
175 aa  186  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 
177 aa  185  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.28 
 
 
183 aa  185  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1356  NADH dehydrogenase subunit B  62.04 
 
 
188 aa  186  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118865  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 
174 aa  185  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  60.99 
 
 
211 aa  184  5e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1260  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
194 aa  184  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1352  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
194 aa  183  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935175  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2220  NADH dehydrogenase subunit B  60.28 
 
 
202 aa  183  9e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1887  NADH dehydrogenase subunit B  62.96 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2919  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.96 
 
 
187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4562  NADH dehydrogenase subunit B  59.57 
 
 
194 aa  181  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4632  NADH dehydrogenase subunit B  62.22 
 
 
194 aa  182  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.625417  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4391  NADH dehydrogenase subunit B  62.96 
 
 
195 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4127  NADH dehydrogenase subunit B  62.96 
 
 
197 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0889  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
192 aa  181  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2398  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.69 
 
 
180 aa  180  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3598  putative NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.11 
 
 
262 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0658  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.11 
 
 
293 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2059  NADH dehydrogenase subunit B  61.97 
 
 
195 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.769624  normal  0.464052 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5810  NADH dehydrogenase subunit B  58.6 
 
 
185 aa  180  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2423  NADH dehydrogenase subunit B  60.87 
 
 
193 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0517  NADH dehydrogenase subunit B  57.72 
 
 
167 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0954  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.11 
 
 
322 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1084  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
195 aa  180  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0355895 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1924  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.11 
 
 
322 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.464401  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1018  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
195 aa  180  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1213  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
195 aa  180  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3570  putative NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.11 
 
 
297 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0803  NADH dehydrogenase subunit B  60.87 
 
 
193 aa  179  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  59.29 
 
 
173 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2573  NADH dehydrogenase subunit B  58.87 
 
 
204 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196668  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2886  NADH dehydrogenase subunit B  58.16 
 
 
199 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.102099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1023  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
190 aa  179  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0798  NADH dehydrogenase subunit B  60.87 
 
 
193 aa  179  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.802177  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  58.27 
 
 
186 aa  179  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3299  NADH dehydrogenase subunit B  58.16 
 
 
198 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  57.14 
 
 
166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2400  NADH dehydrogenase subunit B  57.45 
 
 
201 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.57 
 
 
158 aa  178  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  58.22 
 
 
170 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 
169 aa  177  4.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  53.8 
 
 
170 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.03 
 
 
225 aa  177  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0779  NADH dehydrogenase subunit B  58.62 
 
 
193 aa  177  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.348206  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  56.08 
 
 
165 aa  176  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1713  NADH dehydrogenase subunit B  63.43 
 
 
195 aa  176  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.45 
 
 
170 aa  176  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.27 
 
 
158 aa  175  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.74 
 
 
170 aa  175  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.5 
 
 
188 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.5 
 
 
188 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  54.05 
 
 
170 aa  176  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1310  NADH dehydrogenase subunit B  57.53 
 
 
177 aa  176  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686478  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.33 
 
 
169 aa  175  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  58.7 
 
 
228 aa  174  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  53.64 
 
 
185 aa  175  4e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1929  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 
167 aa  174  4e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.659926  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2983  NADH dehydrogenase subunit B  56.85 
 
 
187 aa  174  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0241  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 
184 aa  174  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.48 
 
 
291 aa  174  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1749  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 
167 aa  174  5e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1563  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 
167 aa  174  5e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.731652  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  55.4 
 
 
158 aa  174  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2830  NADH dehydrogenase subunit B  54.14 
 
 
184 aa  174  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  55.4 
 
 
158 aa  174  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  56.85 
 
 
170 aa  174  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  53.9 
 
 
170 aa  174  7e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  58.87 
 
 
167 aa  174  7e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.45 
 
 
170 aa  174  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1918  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.09 
 
 
229 aa  174  8e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  54.3 
 
 
191 aa  174  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  56.74 
 
 
158 aa  174  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.73 
 
 
169 aa  173  9e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0270  NADH dehydrogenase subunit B  54.79 
 
 
184 aa  173  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  55.4 
 
 
159 aa  173  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  57.55 
 
 
158 aa  173  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1764  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.99 
 
 
158 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381337  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4387  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.56 
 
 
323 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.09 
 
 
191 aa  173  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.167949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>