More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3137 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 		 169 aa  350  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  87.5 
 
 		 170 aa  316  7.999999999999999e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  87.5 
 
 		 170 aa  315  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  88.02 
 
 		 170 aa  312  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  87.43 
 
 		 170 aa  311  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  86.23 
 
 		 170 aa  307  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.44 
 
 		 183 aa  225  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.75 
 
 		 226 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  60.78 
 
 		 216 aa  216  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  56.63 
 
 		 184 aa  215  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  61.01 
 
 		 213 aa  214  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.58 
 
 		 169 aa  214  5e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  62.09 
 
 		 182 aa  214  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  59.62 
 
 		 264 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  62.5 
 
 		 170 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  60.26 
 
 		 271 aa  211  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  59.38 
 
 		 170 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  56.14 
 
 		 199 aa  209  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 172 aa  209  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 172 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 172 aa  209  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 172 aa  209  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  58.82 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 172 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 172 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 172 aa  209  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 172 aa  209  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  55 
 
 		 167 aa  207  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  58.17 
 
 		 226 aa  207  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  61.07 
 
 		 169 aa  207  7e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.63 
 
 		 251 aa  207  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.49 
 
 		 202 aa  205  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  62.24 
 
 		 170 aa  205  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 158 aa  204  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.29 
 
 		 179 aa  204  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  63.57 
 
 		 179 aa  204  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.45 
 
 		 167 aa  204  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.71 
 
 		 158 aa  203  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 		 170 aa  202  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.33 
 
 		 180 aa  202  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  58.82 
 
 		 182 aa  202  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  61.11 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  57.24 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  58.17 
 
 		 158 aa  201  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  57.24 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  58.94 
 
 		 166 aa  201  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  63.38 
 
 		 173 aa  201  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  56.77 
 
 		 158 aa  201  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  57.96 
 
 		 174 aa  200  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.67 
 
 		 158 aa  200  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58 
 
 		 181 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0182  NADH dehydrogenase subunit B  60.84 
 
 		 169 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.13 
 
 		 159 aa  199  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  55.26 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  56.13 
 
 		 160 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  56.13 
 
 		 160 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1929  NADH dehydrogenase subunit B  57.52 
 
 		 167 aa  198  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.659926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  56.6 
 
 		 183 aa  198  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  55.92 
 
 		 184 aa  198  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1563  NADH dehydrogenase subunit B  57.52 
 
 		 167 aa  198  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.731652  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1749  NADH dehydrogenase subunit B  56.86 
 
 		 167 aa  198  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  61.15 
 
 		 268 aa  197  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 		 158 aa  197  6e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  56.49 
 
 		 168 aa  197  6e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  58.17 
 
 		 158 aa  197  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  58.17 
 
 		 158 aa  197  7e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  56.13 
 
 		 158 aa  197  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 		 158 aa  196  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 		 158 aa  196  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02800  conserved hypothetical protein  56.38 
 
 		 250 aa  196  9e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 		 158 aa  196  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  56.13 
 
 		 160 aa  196  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 		 158 aa  196  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  56.13 
 
 		 160 aa  196  9e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0747  NADH dehydrogenase subunit B  58.22 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000169053  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  56.13 
 
 		 160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  57.24 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  56.13 
 
 		 158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55 
 
 		 230 aa  196  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  60.51 
 
 		 268 aa  196  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  54.61 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  54.84 
 
 		 160 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  56.13 
 
 		 159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01288  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 		 182 aa  195  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.92 
 
 		 184 aa  195  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  56.13 
 
 		 159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  56.13 
 
 		 159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0928  NADH dehydrogenase subunit B  54.84 
 
 		 160 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0103047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  56.13 
 
 		 159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  54.61 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1764  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.14 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381337  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  56.13 
 
 		 159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75518  NADH-ubiquinone oxidoreductase  59.44 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.228639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  64.14 
 
 		 250 aa  195  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  56.13 
 
 		 173 aa  195  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>