More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1664 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 
183 aa  377  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  68.49 
 
 
170 aa  228  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  67.12 
 
 
170 aa  227  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  67.12 
 
 
170 aa  226  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  67.12 
 
 
170 aa  226  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  65.75 
 
 
170 aa  225  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.44 
 
 
169 aa  225  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.52 
 
 
226 aa  207  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.87 
 
 
167 aa  205  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  63.45 
 
 
216 aa  205  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  64.14 
 
 
271 aa  204  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  63.45 
 
 
264 aa  204  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  63.01 
 
 
182 aa  202  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  66.67 
 
 
170 aa  202  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.26 
 
 
179 aa  202  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.59 
 
 
169 aa  202  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  63.01 
 
 
179 aa  202  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02800  conserved hypothetical protein  59.87 
 
 
250 aa  201  4e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  61.64 
 
 
179 aa  201  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  62.76 
 
 
226 aa  201  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.83 
 
 
158 aa  200  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  63.19 
 
 
178 aa  199  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  61.64 
 
 
174 aa  200  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  64.49 
 
 
170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
158 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  62 
 
 
184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  63.77 
 
 
172 aa  198  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  63.77 
 
 
172 aa  198  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  63.77 
 
 
172 aa  198  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  63.77 
 
 
179 aa  198  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  63.77 
 
 
179 aa  198  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  63.77 
 
 
179 aa  198  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  63.77 
 
 
172 aa  198  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  63.77 
 
 
172 aa  198  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
167 aa  199  3e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  63.77 
 
 
172 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  63.77 
 
 
172 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  63.5 
 
 
185 aa  197  5e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  63.5 
 
 
179 aa  197  5e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  61.64 
 
 
199 aa  197  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  63.04 
 
 
172 aa  197  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
158 aa  197  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
158 aa  197  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  60.27 
 
 
182 aa  197  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  62.76 
 
 
158 aa  197  7.999999999999999e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  60.58 
 
 
167 aa  197  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.07 
 
 
159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.91 
 
 
180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  63.89 
 
 
158 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  63.89 
 
 
158 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2060  NADH dehydrogenase subunit B  62.76 
 
 
158 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.45 
 
 
158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  60.96 
 
 
167 aa  195  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  61.11 
 
 
158 aa  195  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2272  NADH dehydrogenase subunit B  62.76 
 
 
159 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000536448  normal  0.140602 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  63.64 
 
 
159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  62.24 
 
 
160 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1029  NADH dehydrogenase subunit B  62.76 
 
 
159 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000403774  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  62.24 
 
 
160 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5576  NADH dehydrogenase subunit B  62.76 
 
 
159 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000095063  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  63.64 
 
 
159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  63.64 
 
 
159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2165  NADH dehydrogenase subunit B  62.76 
 
 
159 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00589075  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0182  NADH dehydrogenase subunit B  57.53 
 
 
169 aa  194  4.0000000000000005e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
158 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  63.64 
 
 
159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
158 aa  195  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1636  NADH dehydrogenase subunit B  62.76 
 
 
159 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000193471  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  62.76 
 
 
159 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  62.76 
 
 
159 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  63.64 
 
 
159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
160 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  58.94 
 
 
189 aa  194  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1828  NADH dehydrogenase subunit B  63.64 
 
 
173 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  55.86 
 
 
170 aa  194  6e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1436  NADH dehydrogenase subunit B  63.64 
 
 
173 aa  194  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 
183 aa  194  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  63.64 
 
 
173 aa  194  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 
158 aa  194  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0928  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
160 aa  194  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0103047  normal 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  60.56 
 
 
166 aa  194  6e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0270  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
184 aa  194  7e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2008  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
159 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  57.45 
 
 
169 aa  194  8.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3213  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
159 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737859  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1764  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 
158 aa  194  8.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1344  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
159 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000452822  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  56.85 
 
 
165 aa  193  9e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.88 
 
 
184 aa  194  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
160 aa  193  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  60.27 
 
 
167 aa  194  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
160 aa  193  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
160 aa  193  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2830  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
184 aa  193  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1743  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
158 aa  192  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>