More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0664 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 173 aa  358  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4387  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  88.89 
 
 		 323 aa  308  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  87.27 
 
 		 170 aa  307  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  82.28 
 
 		 291 aa  282  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  81.13 
 
 		 188 aa  281  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  87.5 
 
 		 188 aa  275  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  87.5 
 
 		 188 aa  275  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  64.08 
 
 		 268 aa  199  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  64.08 
 
 		 268 aa  199  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  66.42 
 
 		 264 aa  194  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  65 
 
 		 190 aa  192  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  59.01 
 
 		 189 aa  191  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  67.15 
 
 		 173 aa  191  6e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  65.71 
 
 		 190 aa  191  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  65.71 
 
 		 190 aa  191  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  64.29 
 
 		 189 aa  190  7e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.49 
 
 		 251 aa  190  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  63.04 
 
 		 250 aa  189  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  58.6 
 
 		 189 aa  188  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  58.49 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.49 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 		 222 aa  185  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 		 222 aa  185  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  64.75 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.77 
 
 		 176 aa  184  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.15 
 
 		 225 aa  184  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  62.96 
 
 		 222 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.12 
 
 		 170 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.05 
 
 		 170 aa  181  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  62.32 
 
 		 787 aa  180  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.39 
 
 		 170 aa  179  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.75 
 
 		 183 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  61.76 
 
 		 172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  62.41 
 
 		 172 aa  178  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  62.41 
 
 		 172 aa  178  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  62.41 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  62.41 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  62.41 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  62.41 
 
 		 172 aa  178  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  62.41 
 
 		 172 aa  178  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  62.41 
 
 		 172 aa  177  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  62.41 
 
 		 172 aa  178  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  62.41 
 
 		 172 aa  178  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.34 
 
 		 202 aa  178  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  58.96 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  58.11 
 
 		 793 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  60.58 
 
 		 791 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  59.56 
 
 		 169 aa  177  5.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1126  NADH dehydrogenase subunit B  57.66 
 
 		 212 aa  177  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  58.82 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.57 
 
 		 200 aa  177  9e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3307  NADH dehydrogenase subunit B  58.09 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000318013  normal  0.583268 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.35 
 
 		 167 aa  177  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.608581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  57.66 
 
 		 220 aa  176  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.66 
 
 		 220 aa  176  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  57.66 
 
 		 220 aa  176  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  61.03 
 
 		 792 aa  176  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  57.66 
 
 		 220 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  57.66 
 
 		 220 aa  176  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  57.66 
 
 		 220 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  57.66 
 
 		 220 aa  176  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  57.66 
 
 		 220 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  57.66 
 
 		 220 aa  176  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  57.66 
 
 		 220 aa  176  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  57.66 
 
 		 220 aa  176  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  57.66 
 
 		 220 aa  176  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  59.12 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  57.66 
 
 		 220 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  57.66 
 
 		 220 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  60.15 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  61.94 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1745  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440453  normal  0.328312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4120  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  58.82 
 
 		 213 aa  175  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1815  NADH dehydrogenase subunit B  56.83 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2045  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.33 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0111546  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1561  NADH dehydrogenase subunit B  56.83 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.16 
 
 		 191 aa  175  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1872  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  0.231818 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2831  NADH dehydrogenase subunit B  56.43 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00179676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  54.23 
 
 		 168 aa  175  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3692  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.779049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  61.65 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.65 
 
 		 200 aa  175  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  60.15 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  60.15 
 
 		 176 aa  175  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  60.15 
 
 		 174 aa  175  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30010  NADH dehydrogenase subunit B  58.09 
 
 		 225 aa  175  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3366  NADH dehydrogenase I, B subunit  58.82 
 
 		 224 aa  174  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3198  NADH dehydrogenase subunit B  58.82 
 
 		 224 aa  174  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  0.022092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  60.15 
 
 		 174 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.16 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2413  NADH dehydrogenase subunit B  58.09 
 
 		 225 aa  174  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119197  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2569  NADH dehydrogenase subunit B  58.09 
 
 		 225 aa  174  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  59.4 
 
 		 211 aa  174  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3411  F420H2 dehydrogenase subunit B  53.64 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3604  NADH dehydrogenase subunit B  58.82 
 
 		 224 aa  174  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.39 
 
 		 169 aa  174  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  55.1 
 
 		 794 aa  174  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  55.24 
 
 		 182 aa  174  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>