More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03170 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
182 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  81.87 
 
 
182 aa  323  9e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  78.45 
 
 
199 aa  307  5.9999999999999995e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  74.87 
 
 
226 aa  295  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  74.05 
 
 
216 aa  288  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  83.02 
 
 
181 aa  288  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  83.02 
 
 
185 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  81.76 
 
 
184 aa  285  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  81.37 
 
 
183 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  78.75 
 
 
183 aa  283  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  75.57 
 
 
184 aa  281  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  81.13 
 
 
183 aa  281  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  82.69 
 
 
184 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  72.47 
 
 
184 aa  280  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  72.47 
 
 
184 aa  280  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  75.14 
 
 
184 aa  280  6.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  75 
 
 
184 aa  280  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  79.5 
 
 
184 aa  280  9e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  83.33 
 
 
264 aa  279  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  79.11 
 
 
271 aa  277  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  81.41 
 
 
184 aa  275  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.25 
 
 
184 aa  275  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  72.16 
 
 
226 aa  271  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  73.96 
 
 
226 aa  271  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  74.84 
 
 
183 aa  266  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  75.47 
 
 
183 aa  263  7e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  74.21 
 
 
183 aa  261  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  73.72 
 
 
184 aa  258  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  67.23 
 
 
183 aa  253  8e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  72.26 
 
 
180 aa  244  4e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  66.05 
 
 
174 aa  231  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  68.83 
 
 
179 aa  231  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  66.03 
 
 
213 aa  228  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.44 
 
 
179 aa  225  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  63.23 
 
 
178 aa  225  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  63.76 
 
 
179 aa  223  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  65.79 
 
 
167 aa  221  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  64.47 
 
 
167 aa  218  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.49 
 
 
202 aa  215  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50.83 
 
 
794 aa  210  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.48 
 
 
170 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50.83 
 
 
794 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.48 
 
 
170 aa  208  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  59.48 
 
 
170 aa  208  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.82 
 
 
170 aa  208  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  59.48 
 
 
170 aa  207  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.42 
 
 
200 aa  205  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  53.46 
 
 
168 aa  205  2e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.16 
 
 
200 aa  205  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.16 
 
 
200 aa  204  7e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.82 
 
 
169 aa  202  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  58.82 
 
 
171 aa  201  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 
173 aa  201  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  61.49 
 
 
166 aa  200  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.94 
 
 
169 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  56.89 
 
 
172 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  57.62 
 
 
193 aa  197  7e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  57.33 
 
 
159 aa  197  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.27 
 
 
183 aa  197  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1150  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.87 
 
 
229 aa  197  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  56.89 
 
 
170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50.88 
 
 
791 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  54.67 
 
 
167 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  57.79 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  54.8 
 
 
172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  54.8 
 
 
172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  56.97 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  56.97 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  56.97 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  54.8 
 
 
172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  54.8 
 
 
172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  55.88 
 
 
170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  54.8 
 
 
172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  54.8 
 
 
172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  55.28 
 
 
160 aa  195  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.43 
 
 
230 aa  195  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  55.28 
 
 
160 aa  195  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  56.36 
 
 
172 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  57.79 
 
 
158 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 
159 aa  194  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  56 
 
 
159 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  58.33 
 
 
268 aa  193  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  56 
 
 
213 aa  193  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  51.97 
 
 
182 aa  193  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  55.33 
 
 
159 aa  192  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50 
 
 
792 aa  192  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  58.33 
 
 
268 aa  192  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  55.92 
 
 
158 aa  192  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  55.33 
 
 
159 aa  192  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  54.37 
 
 
170 aa  192  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  49.43 
 
 
793 aa  192  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  55.33 
 
 
159 aa  192  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  55.92 
 
 
158 aa  192  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7018  NADH dehydrogenase subunit B  53.29 
 
 
187 aa  192  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  55.92 
 
 
158 aa  191  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.58 
 
 
158 aa  191  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  55.92 
 
 
158 aa  191  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  57.72 
 
 
264 aa  191  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  57.24 
 
 
158 aa  191  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  52.8 
 
 
170 aa  191  4e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>