More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0924 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 
200 aa  414  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  94 
 
 
200 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  92.5 
 
 
200 aa  390  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  64.05 
 
 
184 aa  217  7e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.22 
 
 
226 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  65.99 
 
 
264 aa  214  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  67.35 
 
 
182 aa  214  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  65.99 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  64.19 
 
 
216 aa  213  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  62.59 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  61.9 
 
 
264 aa  211  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  64.63 
 
 
199 aa  209  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  62.94 
 
 
250 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 
182 aa  205  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  60.81 
 
 
183 aa  204  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 
173 aa  204  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.74 
 
 
180 aa  203  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.54 
 
 
183 aa  203  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  62 
 
 
184 aa  203  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62 
 
 
184 aa  202  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.17 
 
 
181 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  61.33 
 
 
184 aa  201  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  61.33 
 
 
184 aa  201  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  58.28 
 
 
213 aa  201  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  61.33 
 
 
184 aa  201  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  61.33 
 
 
184 aa  201  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  57.52 
 
 
185 aa  201  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 
166 aa  200  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.58 
 
 
183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 
184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.11 
 
 
183 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.68 
 
 
179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  59.33 
 
 
159 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  59.33 
 
 
159 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 
174 aa  198  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  61.97 
 
 
179 aa  197  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  58.67 
 
 
159 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.33 
 
 
184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 
226 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  60.81 
 
 
226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  58.55 
 
 
183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  58.5 
 
 
167 aa  195  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  57.52 
 
 
183 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.39 
 
 
184 aa  194  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  57.82 
 
 
167 aa  194  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  59.21 
 
 
178 aa  194  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  61.22 
 
 
170 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 
158 aa  194  8.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
160 aa  194  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
160 aa  194  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.39 
 
 
251 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.33 
 
 
158 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.86 
 
 
183 aa  191  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  58.67 
 
 
158 aa  191  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  58.67 
 
 
158 aa  191  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.43 
 
 
202 aa  191  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.67 
 
 
158 aa  191  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 
184 aa  191  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0241  NADH dehydrogenase subunit B  52.75 
 
 
184 aa  191  7e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  58.67 
 
 
159 aa  191  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02800  conserved hypothetical protein  47.03 
 
 
250 aa  191  7e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.69 
 
 
170 aa  191  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
158 aa  191  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0270  NADH dehydrogenase subunit B  52.75 
 
 
184 aa  190  9e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.82 
 
 
225 aa  190  9e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 
158 aa  190  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 
170 aa  190  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1494  NADH dehydrogenase subunit B  56.67 
 
 
159 aa  190  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  59.06 
 
 
170 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.83 
 
 
169 aa  190  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2830  NADH dehydrogenase subunit B  52.72 
 
 
184 aa  190  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  59.15 
 
 
172 aa  189  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
158 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
158 aa  189  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
158 aa  189  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  57.05 
 
 
167 aa  189  2e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  55 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01288  NADH dehydrogenase subunit B  52.46 
 
 
182 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  58.74 
 
 
166 aa  189  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 
170 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3255  NADH dehydrogenase subunit B  58.67 
 
 
159 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.551584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.26 
 
 
167 aa  189  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
160 aa  188  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
160 aa  188  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
160 aa  188  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.33 
 
 
159 aa  188  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  60.42 
 
 
170 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  56.67 
 
 
158 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  56.67 
 
 
158 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5576  NADH dehydrogenase subunit B  57.33 
 
 
159 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000095063  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1743  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
158 aa  187  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1636  NADH dehydrogenase subunit B  57.33 
 
 
159 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000193471  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  57.33 
 
 
159 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  57.33 
 
 
159 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1029  NADH dehydrogenase subunit B  57.33 
 
 
159 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000403774  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1425  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
159 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.301169  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>