More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2511 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
220 aa  460  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
220 aa  460  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
220 aa  460  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
220 aa  460  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
220 aa  460  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  99.09 
 
 
220 aa  455  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  99.09 
 
 
220 aa  455  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  99.09 
 
 
220 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  99.09 
 
 
220 aa  455  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  99.09 
 
 
220 aa  455  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  99.09 
 
 
220 aa  455  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  99.09 
 
 
220 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  99.09 
 
 
220 aa  455  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  99.09 
 
 
220 aa  455  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2831  NADH dehydrogenase subunit B  95.98 
 
 
224 aa  448  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00179676  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3307  NADH dehydrogenase subunit B  92.86 
 
 
224 aa  437  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000318013  normal  0.583268 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1561  NADH dehydrogenase subunit B  91.11 
 
 
225 aa  428  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1815  NADH dehydrogenase subunit B  91.11 
 
 
225 aa  428  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2771  NADH dehydrogenase subunit B  89.29 
 
 
224 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1493  NADH dehydrogenase subunit B  88.84 
 
 
224 aa  424  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195904  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1395  NADH dehydrogenase subunit B  88.39 
 
 
224 aa  417  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.125456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1455  NADH dehydrogenase subunit B  90.31 
 
 
227 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2549  NADH dehydrogenase subunit B  87.95 
 
 
224 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.541718  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3604  NADH dehydrogenase subunit B  76.79 
 
 
224 aa  380  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3366  NADH dehydrogenase I, B subunit  76.79 
 
 
224 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3198  NADH dehydrogenase subunit B  76.79 
 
 
224 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  0.022092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2569  NADH dehydrogenase subunit B  77.33 
 
 
225 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2413  NADH dehydrogenase subunit B  76 
 
 
225 aa  374  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119197  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30010  NADH dehydrogenase subunit B  77.33 
 
 
225 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28450  NADH dehydrogenase subunit B  75.45 
 
 
224 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1020  NADH dehydrogenase subunit B  77.23 
 
 
224 aa  371  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4120  NADH dehydrogenase subunit B  75.56 
 
 
225 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1745  NADH dehydrogenase subunit B  75.56 
 
 
225 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440453  normal  0.328312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3692  NADH dehydrogenase subunit B  75.11 
 
 
225 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.779049  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1872  NADH dehydrogenase subunit B  75.11 
 
 
225 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  0.231818 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0380  NADH dehydrogenase subunit B  73.21 
 
 
224 aa  356  9.999999999999999e-98  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.8672  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3131  NADH dehydrogenase subunit B  73.01 
 
 
226 aa  354  5.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  73.21 
 
 
222 aa  350  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  72.77 
 
 
222 aa  349  2e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  72.77 
 
 
222 aa  349  2e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1014  NADH dehydrogenase subunit B  68.75 
 
 
221 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1126  NADH dehydrogenase subunit B  68.23 
 
 
212 aa  301  7.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0717  NADH dehydrogenase subunit B  66.15 
 
 
211 aa  290  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  67.55 
 
 
213 aa  290  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3824  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.02 
 
 
212 aa  281  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1119  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  67.55 
 
 
231 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.722994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2861  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.6 
 
 
213 aa  261  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0909969  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0101  NADH dehydrogenase subunit B  61.05 
 
 
205 aa  245  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0879346  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1737  NADH dehydrogenase subunit B  61.05 
 
 
205 aa  245  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865113  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1348  NADH dehydrogenase subunit B  57.35 
 
 
208 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.675338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  64.12 
 
 
794 aa  244  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  63.53 
 
 
791 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  63.53 
 
 
794 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4070  NADH dehydrogenase subunit B  66.26 
 
 
205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  64.91 
 
 
792 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1690  NADH dehydrogenase subunit B  59.69 
 
 
205 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  59.26 
 
 
793 aa  240  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1327  NADH dehydrogenase subunit B  66.87 
 
 
208 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4742  NADH dehydrogenase subunit B  65.84 
 
 
208 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578905  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  60.74 
 
 
794 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  62.73 
 
 
787 aa  219  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.5 
 
 
170 aa  202  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.6 
 
 
179 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  55.97 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  55.63 
 
 
168 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55 
 
 
170 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.37 
 
 
170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  53.8 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.62 
 
 
180 aa  196  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
213 aa  195  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  54.73 
 
 
271 aa  194  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.08 
 
 
202 aa  194  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 
268 aa  194  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  59.48 
 
 
268 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  54.73 
 
 
264 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  53.8 
 
 
178 aa  193  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  57.05 
 
 
264 aa  192  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  54.3 
 
 
182 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.64 
 
 
226 aa  190  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.62 
 
 
169 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  49.43 
 
 
183 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  51.5 
 
 
182 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  54.3 
 
 
199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.6 
 
 
191 aa  189  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  52.5 
 
 
170 aa  188  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  54.05 
 
 
184 aa  188  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.69 
 
 
230 aa  187  8e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.66 
 
 
183 aa  187  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  51.88 
 
 
170 aa  187  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  53.01 
 
 
250 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  53.64 
 
 
174 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  53.64 
 
 
184 aa  186  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.81 
 
 
184 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  52.7 
 
 
183 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.48 
 
 
183 aa  185  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  52.32 
 
 
226 aa  185  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  52.32 
 
 
179 aa  184  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  52.32 
 
 
226 aa  184  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  54.73 
 
 
173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.01 
 
 
183 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>