More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4243 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 		 170 aa  350  7e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  92.94 
 
 		 170 aa  335  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  92.35 
 
 		 170 aa  334  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  89.41 
 
 		 170 aa  322  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  89.41 
 
 		 170 aa  322  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  86.23 
 
 		 169 aa  307  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  68.49 
 
 		 183 aa  228  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  63.75 
 
 		 213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  56.25 
 
 		 167 aa  216  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  61.44 
 
 		 216 aa  214  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.78 
 
 		 226 aa  213  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.19 
 
 		 202 aa  213  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  55.68 
 
 		 182 aa  212  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 271 aa  211  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.5 
 
 		 158 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  61.84 
 
 		 158 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.26 
 
 		 169 aa  210  7e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  53.53 
 
 		 184 aa  209  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  56.29 
 
 		 264 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.97 
 
 		 180 aa  209  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  59.48 
 
 		 182 aa  208  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.33 
 
 		 158 aa  208  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  62.59 
 
 		 172 aa  208  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  62.59 
 
 		 172 aa  208  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  62.59 
 
 		 172 aa  208  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  62.59 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  62.59 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  62.59 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  62.59 
 
 		 172 aa  208  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  61.54 
 
 		 170 aa  207  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  62.59 
 
 		 172 aa  208  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  62.59 
 
 		 172 aa  208  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  62.59 
 
 		 172 aa  207  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  61.29 
 
 		 170 aa  207  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  58.82 
 
 		 158 aa  207  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  53.8 
 
 		 184 aa  207  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.87 
 
 		 159 aa  207  6e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  55.62 
 
 		 199 aa  206  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  59.21 
 
 		 158 aa  206  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  59.21 
 
 		 158 aa  206  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  59.21 
 
 		 158 aa  206  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 		 169 aa  206  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  61.9 
 
 		 172 aa  206  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  59.21 
 
 		 158 aa  206  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  59.21 
 
 		 158 aa  206  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  61.29 
 
 		 167 aa  206  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  58.71 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 		 160 aa  205  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 		 160 aa  205  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  57.42 
 
 		 158 aa  205  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.5 
 
 		 179 aa  205  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  56.88 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  61.97 
 
 		 170 aa  205  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.53 
 
 		 167 aa  204  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  57.42 
 
 		 158 aa  204  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.78 
 
 		 251 aa  204  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 167 aa  204  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  57.5 
 
 		 220 aa  204  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.5 
 
 		 220 aa  204  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  59.6 
 
 		 166 aa  204  6e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  57.5 
 
 		 220 aa  204  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  57.5 
 
 		 220 aa  204  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  57.5 
 
 		 220 aa  204  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  57.5 
 
 		 220 aa  204  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  57.5 
 
 		 220 aa  204  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  57.5 
 
 		 220 aa  204  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  57.5 
 
 		 220 aa  204  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 		 160 aa  204  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  61.27 
 
 		 170 aa  203  7e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02800  conserved hypothetical protein  56.69 
 
 		 250 aa  203  8e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0928  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 		 160 aa  203  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0103047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  56.25 
 
 		 159 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  58.49 
 
 		 213 aa  202  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  57.5 
 
 		 220 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2830  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 		 184 aa  202  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  57.5 
 
 		 220 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  57.96 
 
 		 174 aa  203  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  57.5 
 
 		 220 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  61.22 
 
 		 167 aa  203  1e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  57.5 
 
 		 220 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  57.5 
 
 		 220 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 		 160 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 		 160 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2060  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 		 158 aa  202  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0241  NADH dehydrogenase subunit B  59.62 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  56.21 
 
 		 168 aa  202  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1764  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.87 
 
 		 158 aa  202  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381337  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 		 160 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2165  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 		 159 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00589075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2008  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 		 159 aa  201  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2272  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 		 159 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000536448  normal  0.140602 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5576  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 		 159 aa  201  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000095063  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 		 158 aa  201  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 		 173 aa  201  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0270  NADH dehydrogenase subunit B  59.87 
 
 		 184 aa  201  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 		 159 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 		 159 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 		 159 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 		 159 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 		 159 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>