More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3358 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 		 202 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  64.81 
 
 		 173 aa  222  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  62.99 
 
 		 184 aa  218  7e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.46 
 
 		 226 aa  217  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  62.82 
 
 		 216 aa  217  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1543  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  67.83 
 
 		 175 aa  216  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  61.49 
 
 		 182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  63.89 
 
 		 213 aa  214  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  56.35 
 
 		 271 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  66.22 
 
 		 182 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.19 
 
 		 170 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62 
 
 		 170 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.34 
 
 		 180 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  63.51 
 
 		 170 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  62.84 
 
 		 264 aa  211  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.33 
 
 		 170 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56 
 
 		 184 aa  211  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  57.23 
 
 		 184 aa  209  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  62.16 
 
 		 170 aa  208  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  53.42 
 
 		 168 aa  208  4e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  66.22 
 
 		 166 aa  207  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  60.39 
 
 		 184 aa  207  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.16 
 
 		 184 aa  206  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  61.04 
 
 		 183 aa  206  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  62.84 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  60.4 
 
 		 159 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  61.69 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  53.98 
 
 		 184 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  61.69 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.49 
 
 		 169 aa  205  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.43 
 
 		 181 aa  205  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  58.6 
 
 		 264 aa  205  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  56.8 
 
 		 250 aa  204  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  59.74 
 
 		 184 aa  204  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  54.97 
 
 		 183 aa  204  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  60.81 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  60.81 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  60.81 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  60.4 
 
 		 159 aa  203  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  58.71 
 
 		 193 aa  204  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  60.81 
 
 		 172 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  60.81 
 
 		 172 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  59.74 
 
 		 185 aa  203  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  59.33 
 
 		 172 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.74 
 
 		 184 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  60.81 
 
 		 172 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  60.81 
 
 		 172 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  60.81 
 
 		 172 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  60.81 
 
 		 172 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 		 167 aa  202  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  60.81 
 
 		 172 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  59.73 
 
 		 159 aa  202  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.24 
 
 		 183 aa  202  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  58.28 
 
 		 268 aa  202  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.74 
 
 		 183 aa  202  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  54.12 
 
 		 179 aa  202  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  59.09 
 
 		 167 aa  202  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  55.42 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  55.42 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  59.09 
 
 		 167 aa  201  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  59.06 
 
 		 159 aa  202  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  59.06 
 
 		 159 aa  202  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.96 
 
 		 158 aa  201  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  53.89 
 
 		 174 aa  201  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  57.06 
 
 		 268 aa  201  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.84 
 
 		 179 aa  201  8e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  60.81 
 
 		 183 aa  201  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.43 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  60.14 
 
 		 179 aa  200  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  60.54 
 
 		 171 aa  199  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.32 
 
 		 159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1743  NADH dehydrogenase subunit B  57.96 
 
 		 158 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  57.32 
 
 		 158 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  57.32 
 
 		 158 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 		 184 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  57.32 
 
 		 158 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1556  NADH dehydrogenase subunit B  62.5 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 		 178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.27 
 
 		 183 aa  198  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.85 
 
 		 794 aa  198  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  56.69 
 
 		 158 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.85 
 
 		 794 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  56.69 
 
 		 158 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1617  NADH dehydrogenase subunit B  55.26 
 
 		 161 aa  196  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025993  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0546  NADH dehydrogenase subunit B  55.26 
 
 		 161 aa  196  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  54.78 
 
 		 160 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  56.69 
 
 		 159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  60.87 
 
 		 169 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0747  NADH dehydrogenase subunit B  52.38 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000169053  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  54.78 
 
 		 160 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2060  NADH dehydrogenase subunit B  56.69 
 
 		 158 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.14 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.39 
 
 		 158 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.21 
 
 		 183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  56.08 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  56.08 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  56.08 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  56.08 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  56.08 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  61.15 
 
 		 787 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>